[room] Софт для студентов-химиков

[room] Софт для студентов-химиков

[Michael Holzman]

Господа курильщики!

Один из моих родственников осчастливил своих родителей поступлением на
химфак. Меня попросили подобрать ему софт. Проблемы заключаются в том,
что, во-первых, я бывший физик и оценить полезность продукта не могу.
А, во-вторых, вообще очень давно не смотрел на обучающие/помогающие
программы. Не знаю, что вообще существует и с чем его едят.

Окажите, пожалуйста, помощь молодому студенту.

-- 
С уважением,
    Михаил

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Denis G. Samsonenko]

Привет!

29.08.07, Michael Holzman написал:
> Один из моих родственников осчастливил своих родителей поступлением на
> химфак. Меня попросили подобрать ему софт. Проблемы заключаются в том,
> что, во-первых, я бывший физик и оценить полезность продукта не могу.
> А, во-вторых, вообще очень давно не смотрел на обучающие/помогающие
> программы. Не знаю, что вообще существует и с чем его едят.

В Сизифе была пара программ. Вопрос в том, что конкретно этому
студенту нужно будет. Когда я учился, компьютер нам нужен был очень
редко, по крайней мере до третьего курса.

А дальше зависит всё от специализации и задач. Каких-то общих программ
не много. Основная проблема на мой взгляд в том, что много химического
софта написано именно под Win, и научные журналы принимают статьи в
основном в doc. И этого трудно избежать. Потому как химик никогда не
работает один (если он не теоретик, но это уже скорее физик, чем
химик), а всё окружение вокруг работает под Win.

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Michael Holzman]

On 8/29/07, Denis G. Samsonenko <d.g.samsonenko@gmail.com> wrote:
> В Сизифе была пара программ. Вопрос в том, что конкретно этому
> студенту нужно будет.
Кто же это знает? Его родитель просто хочет облегчить отпрыску,
по-возможности, жизнь. Например, справочники всякие, считающие проги и
тому подобное.
>
> А дальше зависит всё от специализации и задач. Каких-то общих программ
> не много. Основная проблема на мой взгляд в том, что много химического
> софта написано именно под Win, и научные журналы принимают статьи в
> основном в doc. И этого трудно избежать. Потому как химик никогда не
> работает один (если он не теоретик, но это уже скорее физик, чем
> химик), а всё окружение вокруг работает под Win.
Это вообще не проблема. Единственное, к сожалению,  что он знает - это Win.
А сюда я обратился потому, что это единственное из посещаемых мною
мест, где в большом количестве водятся говорящие по-русски химики :-)


-- 
Regards,
    Michael Holzman

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Denis G. Samsonenko]

Привет!

29.08.07, Michael Holzman написал:
> > В Сизифе была пара программ. Вопрос в том, что конкретно этому
> > студенту нужно будет.
> Кто же это знает? Его родитель просто хочет облегчить отпрыску,
> по-возможности, жизнь. Например, справочники всякие, считающие проги и
> тому подобное.

Справочников в виде софта я не встречал. А считающие проги на первых
трёх курсах я даже и не знаю, какие ему предложить, разве что
калькулятор для подсчёта молярной/молекулярной массы.

Мне кажется, что ему компьютер не понадобится в ближайшие пару лет.
Максимум что ему будет надо -- это хороший калькулятор. Ну и офисный
пакет для написания курсовых.

> > А дальше зависит всё от специализации и задач. Каких-то общих программ
> > не много. Основная проблема на мой взгляд в том, что много химического
> > софта написано именно под Win, и научные журналы принимают статьи в
> > основном в doc. И этого трудно избежать. Потому как химик никогда не
> > работает один (если он не теоретик, но это уже скорее физик, чем
> > химик), а всё окружение вокруг работает под Win.
> Это вообще не проблема. Единственное, к сожалению,  что он знает - это Win.

Ну, кому как.

> А сюда я обратился потому, что это единственное из посещаемых мною
> мест, где в большом количестве водятся говорящие по-русски химики :-)

Ну химики-то есть. Вот только софт я предложить не смогу. Весь софт у
нас в основном специализированный, и зачастую идёт в поставке вместе с
прибором, а в последнее время это в основном Win.

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Michael Holzman]

On 8/29/07, Denis G. Samsonenko <d.g.samsonenko@gmail.com> wrote:
>
> > А сюда я обратился потому, что это единственное из посещаемых мною
> > мест, где в большом количестве водятся говорящие по-русски химики :-)
>
> Ну химики-то есть. Вот только софт я предложить не смогу. Весь софт у
> нас в основном специализированный, и зачастую идёт в поставке вместе с
> прибором, а в последнее время это в основном Win.
Понял. Жаль.
Спасибо за разъяснения.

Закрываем тему.
-- 
Regards,
    Michael Holzman

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Avramenko Andrew]

Michael Holzman пишет:

> я бывший физик и оценить полезность продукта не могу.

А Вы что-нибудь использовали в студенческие времена?
Лично мне компьютер был нужен только как средство чтения электронных 
книжек (а их у меня была масса) и текстовый редактор для составления 
протоколов к лабораторным работам :-)

Есть подозрение, что химикам нужно то же самое. Ведь я,так понял, не 
ставится целью сделать из человека ученого, а нужно облегчить процесс 
обучения :)

--
С уважением,
Андрей

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Alexei V. Mezin]

Avramenko Andrew пишет:
> Есть подозрение, что химикам нужно то же самое. Ведь я,так понял, не 
> ставится целью сделать из человека ученого, а нужно облегчить процесс 
> обучения :)

Ну не знаю, как там у химиков (сдается мне что не сильно иначе), а у 
физиков бывают лабораторные работы, экспериментальные данные, графики с 
точками с "усами" погрешностей, прямые по ним "наименьшими квадратами" и 
т.п. Поэтому gnuplot иди аналог очень полезная штука. Но если без особых 
претензий, то и OOCalc подойдет :)

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Avramenko Andrew]

Alexei V. Mezin пишет:
> Avramenko Andrew пишет:
>> Есть подозрение, что химикам нужно то же самое. Ведь я,так понял, не 
>> ставится целью сделать из человека ученого, а нужно облегчить процесс 
>> обучения :)
> 
> Ну не знаю, как там у химиков (сдается мне что не сильно иначе), а у 
> физиков бывают лабораторные работы, экспериментальные данные, графики с 
> точками с "усами" погрешностей, прямые по ним "наименьшими квадратами" и 
> т.п. Поэтому gnuplot иди аналог очень полезная штука. Но если без особых 
> претензий, то и OOCalc подойдет :)

Да-да.. Вспоминаю знакомые слова. Дело в том, что мой преподавать 
довольно регулярно спрашивал о том _как_ я строил этот график. Поэтому 
все рассчеты на обратной стороне протокола, все графики карандашом и 
линейкой :)

Вот только обсчет данных в электронных таблицах иногда делал, когда 
сильно много :)

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Denis G. Samsonenko]

День добрый!

29.08.07, Alexei V. Mezin написал:
> > Есть подозрение, что химикам нужно то же самое. Ведь я,так понял, не
> > ставится целью сделать из человека ученого, а нужно облегчить процесс
> > обучения :)
>
> Ну не знаю, как там у химиков (сдается мне что не сильно иначе), а у
> физиков бывают лабораторные работы, экспериментальные данные, графики с
> точками с "усами" погрешностей, прямые по ним "наименьшими квадратами" и
> т.п. Поэтому gnuplot иди аналог очень полезная штука. Но если без особых
> претензий, то и OOCalc подойдет :)

Калькулятор за 30 баксов с этим справится по любому. А графики на
миллиметровке рисовать. :)

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Michael Shigorin]

[-- Attachment #1: Type: text/plain, Size: 1651 bytes --]

On Tue, Aug 28, 2007 at 09:55:30PM +0300, Michael Holzman wrote:
> Один из моих родственников осчастливил своих родителей
> поступлением на химфак. Меня попросили подобрать ему софт.
> Проблемы заключаются в том, что, во-первых, я бывший физик и
> оценить полезность продукта не могу.  А, во-вторых, вообще
> очень давно не смотрел на обучающие/помогающие программы. Не
> знаю, что вообще существует и с чем его едят.

Совсем негусто и скорее специфика, но кое-что есть:
http://sisyphus.ru/packages/Sciences/Chemistry

Пособирать можно ещё достаточно чего, был бы смысл.
Например, лежит полузапиленный gromacs.spec (цепляю).

Надо уточнить специальность или интерес, поскольку 
он в нормальном случае её опережает.

Ну и книжки/люди до появления предметных целей куда
важнее любых программ и даже гугля.

On Wed, Aug 29, 2007 at 01:43:46PM +0400, Alexei V. Mezin wrote:
> > Есть подозрение, что химикам нужно то же самое. Ведь я,так
> > понял, не ставится целью сделать из человека ученого, а нужно
> > облегчить процесс обучения :)
> Ну не знаю, как там у химиков (сдается мне что не сильно
> иначе), а у физиков бывают лабораторные работы,
> экспериментальные данные, графики с точками с "усами"
> погрешностей, прямые по ним "наименьшими квадратами" и т.п.
> Поэтому gnuplot иди аналог очень полезная штука. Но если без
> особых претензий, то и OOCalc подойдет :)

У химиков тоже (а лабы я строил при помощи xmgr/grace,
последнее упаковано; пару раз подбирался к scigraphica,
но последний раз не очень давно опять обломался --
кажется, --as-needed).

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

[-- Attachment #2: gromacs.spec --]
[-- Type: text/plain, Size: 3033 bytes --]

Name: gromacs
Version: 3.3.1
Release: alt1

Summary: Molecular dynamics package (non-mpi version)
License: GPL
Group: Sciences/Chemistry

Url: http://www.gromacs.org
Source: ftp://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/%name-%version.tar.gz
Packager: Michael Shigorin <mike@altlinux.org>

Requires: libfftw >= 3.0.1
BuildRequires: libfftw-devel
BuildRequires: xorg-x11-devel

%description
GROMACS is a versatile and extremely well optimized package
to perform molecular dynamics computer simulations and
subsequent trajectory analysis. It is developed for
biomolecules like proteins, but the extremely high
performance means it is used also in several other field
like polymer chemistry and solid state physics. This
version has the dynamic libs and executables; to hack new
utility programs you also need the headers and static
libs in gromacs-devel*. Linux kernel 2.4 or later is STRONGLY
recommended on Pentium III and later processors since
GROMACS then can use assembly loops with SSE instructions.
You can also perform parallel simulations if you install
gromacs-lammpi.

%package devel
Summary: Header files and development part of libraries for GROMACS
Group: Development/C++

%description devel
This package contains header files, development part of
libraries, and a program example for the GROMACS molecular
dynamics software. You need it if you want to write your
own analysis programs.

%package devel-static
Summary: Header files and static libraries for GROMACS
Group: Development/C++

%description devel-static
This package contains static libraries for the GROMACS molecular
dynamics software. You need it if you want to build your
programs statically against GROMACS (which you probably don't).

%prep
%setup -q
exit 1

%build
%configure \
	--disable-rpath \
	--enable-shared \
	--without-motif-libraries
%make

%install
%makeinstall

%files
%doc AUTHORS COPYING README
%_bindir/*
%_libdir/*.so.*
%_man1dir/*
%_datadir/%name

%files devel
%_includedir/*
%_libdir/*.so

%files devel-static
%_libdir/*.a

# TODO:
# - build mpi-enabled version from the same spec?
#   (see gromacs-mpi.spec in admin/)
# - (maybe) build motif UI from the same spec

%changelog
* Thu Jan 04 2007 Michael Shigorin <mike@altlinux.org> 3.3.1-alt1
- built for ALT Linux (based on Mandriva contrib spec 
  by Lenny Cartier <lenny/mandriva.com> and original
  one by Erik Lindahl <lindahl/gromacs.org>)
- disable GUI build by default

* Tue Apr 11 2006 Lenny Cartier <lenny@mandriva.com> 3.3.1-1mdk
- 3.3.1

* Mon Nov 07 2005 Nicolas LИcureuil <neoclust@mandriva.org> 3.3-2mdk
- Fix BuildRequires

* Thu Oct 20 2005 Lenny Cartier <lenny@mandriva.com> 3.3-1mdk
- 3.3

* Fri Jun 04 2004 Lenny Cartier <lenny@mandrakesoft.com> 3.2.1-1mdk
- 3.2.1

* Wed Apr 30 2003 Lenny Cartier <lenny@mandrakesoft.com> 3.1.4-3mdk
- buildrequires

* Sun Feb 02 2003 Lenny Cartier <lenny@mandrakesoft.com> 3.1.4-2mdk
- rebuild

* Tue Dec 05 2002 Lenny Cartier <lenny@mandrakesoft.com> 3.1.4-1mdk
- from Austin Acton <aacton@yorkul.ca> :
	- initial package for Mandrake 9.0+

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Michael Holzman]

On 8/31/07, Michael Shigorin <mike@osdn.org.ua> wrote:
> Совсем негусто и скорее специфика, но кое-что есть:
> http://sisyphus.ru/packages/Sciences/Chemistry
Пошел смотреть.

> Пособирать можно ещё достаточно чего, был бы смысл.
> Например, лежит полузапиленный gromacs.spec (цепляю).
>
> Надо уточнить специальность или интерес, поскольку
> он в нормальном случае её опережает.
Если бы он знал. Я специально спрашивал - молчит как партизан.
Насколько я его знаю, скорее всего пойдет по проторенной его мамой и
ее знакомыми дорожке в сторону стекла и эмалей.

> Ну и книжки/люди до появления предметных целей куда
> важнее любых программ и даже гугля.
Очевидно. Это ему уже объяснили :-)

-- 
Regards,
    Michael Holzman

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Denis Medvedev]

scilab и xmds тоже посмотрите - там химических примеров 
много. www.xmds.org


-----Original Message-----
From: "Michael Holzman" <michaelholzman@gmail.com>
To: shigorin@gmail.com,"культурный офтопик" 
<smoke-room@lists.altlinux.org>
Date: Fri, 31 Aug 2007 10:22:47 +0300
Subject: Re: [room] Софт для студентов-химиков

> On 8/31/07, Michael Shigorin <mike@osdn.org.ua> wrote:
> > Совсем негусто и скорее специфика, но кое-что есть:
> > http://sisyphus.ru/packages/Sciences/Chemistry
> Пошел смотреть.
> 
> > Пособирать можно ещё достаточно чего, был бы смысл.
> > Например, лежит полузапиленный gromacs.spec (цепляю).
> >
> > Надо уточнить специальность или интерес, поскольку
> > он в нормальном случае её опережает.
> Если бы он знал. Я специально спрашивал - молчит как 
партизан.
> Насколько я его знаю, скорее всего пойдет по проторенной 
его мамой и
> ее знакомыми дорожке в сторону стекла и эмалей.
> 
> > Ну и книжки/люди до появления предметных целей куда
> > важнее любых программ и даже гугля.
> Очевидно. Это ему уже объяснили :-)
> 
> -- 
> Regards,
>     Michael Holzman
> _______________________________________________
> smoke-room mailing list
> smoke-room@lists.altlinux.org
> https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/smoke-room

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Michael Holzman]

On 8/31/07, Denis Medvedev <a_mdl@mail.ru> wrote:
> scilab и xmds тоже посмотрите - там химических примеров
> много. www.xmds.org

Спасибо. Уже смотрю.

-- 
Regards,
    Michael Holzman

Re: [room] Софт для студентов-химиков

[Michael Holzman]

On 8/29/07, Avramenko Andrew <liksx@mail.ru> wrote:
> Michael Holzman пишет:
>
> > я бывший физик и оценить полезность продукта не могу.
>
> А Вы что-нибудь использовали в студенческие времена?
> Лично мне компьютер был нужен только как средство чтения электронных
> книжек (а их у меня была масса) и текстовый редактор для составления
> протоколов к лабораторным работам :-)
В мое время у нас в университете было следующее:
М-222 - мой первый компьютер (даже не знаю, что означает М. Наверное "Минск"
ЕС-1020-1060 - несколько разных
СМ-4 и 1420

Доступ ко всем был через перфокарты (СМки работали с перфолентами) и
сильно ограничен. Словосочетаний "электронная книжка", "текстовый
редактор" и им подобных в русском повседневном языке еще не было :-)
Зато я помню свое счастье, когда мне удалось получить доступ к живому
цветному (зеленому) CRT терминалу и самостоятельно набивать
перфокарты.

-- 
Regards,
    Michael Holzman