[sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[aa paa]

Здравствуйте уважаемые читатели данной рассылки!
Руководство поставило задачу в компьютерном классе для работы с
кластером (предварительная подготовка каких-то моделей) установить
следующие программы
1. ElmerGUI,
2. XCrysDen,
3. OpenCASCADE
4. GnuPlot
5. ParaView

В классе свежеустановленный Школьный Юниор с GNOME Из всего списка
программ В репозитории есть только GnuPlot (работает) и OpenCASCADE
(установил но не смог запустить не в меню не в консоли).
Может кто-либо уже собирал данные программы под АЛТ, не хочется мне на
убунту почему-то переходить, а пакеты самому собрать пока слабо.
Помогите опакетить кто может?

С уважением Алексей

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Радик Юсупов]

29.05.2010 11:17, aa paa пишет:
> Здравствуйте уважаемые читатели данной рассылки!
> Руководство поставило задачу в компьютерном классе для работы с
> кластером (предварительная подготовка каких-то моделей) установить
> следующие программы
> 1. ElmerGUI,
> 2. XCrysDen,
> 3. OpenCASCADE
> 4. GnuPlot
> 5. ParaView
>
> В классе свежеустановленный Школьный Юниор с GNOME Из всего списка
> программ В репозитории есть только GnuPlot (работает) и OpenCASCADE
> (установил но не смог запустить не в меню не в консоли).
> Может кто-либо уже собирал данные программы под АЛТ, не хочется мне на
> убунту почему-то переходить, а пакеты самому собрать пока слабо.
> Помогите опакетить кто может?
>    
Советую Вам создать запрос в багзилле по каждому из необходимых компонентов.
Адрес багзиллы: 
https://bugzilla.altlinux.org/enter_bug.cgi?product=New%2Fproposed%20packages

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

aa paa пишет:
> OpenCASCADE
> (установил но не смог запустить не в меню не в консоли).

У апстрима нет .desktop файлов. Можете создать сами и поделиться 
творением. Что касается запуска в консоли: а что конкретно не получилось?

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

aa paa пишет:
> Opencascad запустился в консоли командой
> DRAWEXE
> Навено это он :)

А что не так-то?

PS. Вообще, OpenCASCADE в основном предназначен для разработки 
приложений (пакет libopencascade-devel). В частности, в Сизифе есть 
два приложения, которые его используют: free-cad и netgen. А команда 
DRAWEXE - это простенький тест.
http://www.opencascade.org/org/gettingstarted/install/draw/

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[aa paa]

> У апстрима нет .desktop файлов. Можете создать сами и поделиться
> творением. Что касается запуска в консоли: а что конкретно не получилось?
> REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ
> _______________________________________________

По поводу создать самт поискал в Гугле ничего не нашёл вразумительного
(как создать .desktop)
Opencascad запустился в консоли командой
DRAWEXE
Навено это он :)

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Sat, May 29, 2010 at 11:17:33AM +0400, aa paa wrote:
> Помогите опакетить кто может?

Если не горит, то можно потихоньку за лето и помочь.

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Anton A. Vinogradov]

02.06.2010 22:37, Michael Shigorin пишет:
> On Sat, May 29, 2010 at 11:17:33AM +0400, aa paa wrote:
>> Помогите опакетить кто может?
>
> Если не горит, то можно потихоньку за лето и помочь.
>
+ меня в помогающие запишите :)

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[aa paa]

02.06.10, Anton A. Vinogradov<vinogradov.mail@gmail.com> написал(а):
> 02.06.2010 22:37, Michael Shigorin пишет:
>> On Sat, May 29, 2010 at 11:17:33AM +0400, aa paa wrote:
>>> Помогите опакетить кто может?
>>
>> Если не горит, то можно потихоньку за лето и помочь.
>>
> + меня в помогающие запишите :)
> _______________________________________________
> Sisyphus mailing list
> Sisyphus@lists.altlinux.org
> https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/sisyphus
Буду очень признателен!
Да не горит особо-то, к началу учебного года нужно, Ну к концу августа
чтобы посмотреть ещё успели преподаватели Всё ли так.

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Aleksey Cheusov]

> Здравствуйте уважаемые читатели данной рассылки!
> Руководство поставило задачу в компьютерном классе для работы с
> кластером (предварительная подготовка каких-то моделей) установить
> следующие программы
> 1. ElmerGUI,
> 2. XCrysDen,
> 3. OpenCASCADE
> 4. GnuPlot
> 5. ParaView

> В классе свежеустановленный Школьный Юниор с GNOME Из всего списка
> программ В репозитории есть только GnuPlot (работает) и OpenCASCADE
> (установил но не смог запустить не в меню не в консоли).
> Может кто-либо уже собирал данные программы под АЛТ, не хочется мне на
> убунту почему-то переходить, а пакеты самому собрать пока слабо.
> Помогите опакетить кто может?

До кучи. Простая программа для обработки независимых задач в кластере или
на различных процессорах или графа задач (ребро - для задачи B сделай
сначала задачу A). Устойчивость к сетевым сбоям и другие мелкие фишки.

http://sourceforge.net/projects/paexec

Может, пригодится.

-- 
Best regards, Aleksey Cheusov.

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Fri, Jun 04, 2010 at 12:38:32PM +0400, aa paa wrote:
> >>> Помогите опакетить кто может?
> >> Если не горит, то можно потихоньку за лето и помочь.
> > + меня в помогающие запишите :)
> Буду очень признателен!
> Да не горит особо-то, к началу учебного года нужно, Ну к концу
> августа чтобы посмотреть ещё успели преподаватели Всё ли так.

Тогда Вы поучитесь его вообще собирать (из распакованных
исходников, но не устанавливая make install'ом), а как это будет
освоено -- можно и в пакет.

(если ещё ничего не собирали -- так и скажите, сперва это разучим)

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Alexey Piguzov]

02.06.10, Michael Shigorin<mike@osdn.org.ua> написал(а):
> On Sat, May 29, 2010 at 11:17:33AM +0400, aa paa wrote:
>> Помогите опакетить кто может?
>
> Если не горит, то можно потихоньку за лето и помочь.
>
> --
>  ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
>   ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/
> _______________________________________________
> Sisyphus mailing list
> Sisyphus@lists.altlinux.org
> https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/sisyphus

Здравствуйте, Михаил!
Как насчет сборки данных пакетов? Или совсем некогда.7

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Tue, Aug 24, 2010 at 07:01:02PM +0400, Alexey Piguzov wrote:
> >> Помогите опакетить кто может?
> > Если не горит, то можно потихоньку за лето и помочь.
> Как насчет сборки данных пакетов? Или совсем некогда.7

Сейчас сложно, но попробовать-то можно.
Сами за это время не подступались?

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Rinat Bikov]

24 августа 2010 г. 19:01 пользователь Alexey Piguzov написал:
> Здравствуйте, Михаил!
> Как насчет сборки данных пакетов? Или совсем некогда.7
А для какой архитектуры необходимо собрать? x86_32 или x86_64?

-- 
С уважением, Ринат Биков.

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Alexey Piguzov]

30.08.10, Rinat Bikov<becase@altlinux.org> написал(а):
> 24 августа 2010 г. 19:01 пользователь Alexey Piguzov написал:
>> Здравствуйте, Михаил!
>> Как насчет сборки данных пакетов? Или совсем некогда.7
> А для какой архитектуры необходимо собрать? x86_32 или x86_64?
>
> --
> С уважением, Ринат Биков.
> _______________________________________________
> Sisyphus mailing list
> Sisyphus@lists.altlinux.org
> https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/sisyphus
Для x86_32. Будем очень признательны.

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Thu, Sep 02, 2010 at 08:54:33AM +0400, Alexey Piguzov wrote:
> >> Как насчет сборки данных пакетов? Или совсем некогда.7
> > А для какой архитектуры необходимо собрать? x86_32 или x86_64?
> Для x86_32. Будем очень признательны.

Список напомните? (лучше сразу домашние страницы)

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Alexey Piguzov]

Сайты поискал , но могу ошибаться.
1. ElmerGUI,  http://www.csc.fi/english/pages/elmer
2. XCrysDen, www.xcrysden.org/
3. OpenCASCADE это не надо есть в бранче
4. GnuPlot это тоже есть
5. ParaView www.paraview.org

02.09.10, Michael Shigorin<mike@osdn.org.ua> написал(а):
> On Thu, Sep 02, 2010 at 08:54:33AM +0400, Alexey Piguzov wrote:
>> >> Как насчет сборки данных пакетов? Или совсем некогда.7
>> > А для какой архитектуры необходимо собрать? x86_32 или x86_64?
>> Для x86_32. Будем очень признательны.
>
> Список напомните? (лучше сразу домашние страницы)
>
> --
>  ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
>   ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/
> _______________________________________________
> Sisyphus mailing list
> Sisyphus@lists.altlinux.org
> https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/sisyphus

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

Alexey Piguzov пишет:
> Сайты поискал , но могу ошибаться.
> 1. ElmerGUI,  http://www.csc.fi/english/pages/elmer

За это могу взяться я, когда завершу опакечивание COIN-OR (это такая 
хорошая штука: http://www.coin-or.org/ ) и Berkeley UPC 
(http://upc.lbl.gov/ ). Если его (Элмера) не опакетит кто-то раньше.

> 5. ParaView www.paraview.org

А позднее и это.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Thu, Sep 02, 2010 at 04:29:35PM +0400, Alexey Piguzov wrote:
> 2. XCrysDen, www.xcrysden.org/

Отправил вместе с рекомендованным ungifsicle в сизиф,
src.rpm должен пересобираться и на бранче.  Простые и приятные.

> 5. ParaView www.paraview.org

С этим сложней (хотя будто не настолько, как с elmer):
пока запоролся на cmake + libhdf5-devel и до возможности
проверки кем-нить сведущим в OpenMPI выключил сборку обоих
MPI-вариантов (плюс #24010).

2 real: если будет минутка -- выложил перепотрошённый федорин:
http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/paraview-3.8.0-alt0.1.src.rpm

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Fri, Sep 03, 2010 at 09:50:16AM +0800, REAL wrote:
> >Сайты поискал , но могу ошибаться.
> >1. ElmerGUI,  http://www.csc.fi/english/pages/elmer
> За это могу взяться я, когда завершу опакечивание COIN-OR (это
> такая хорошая штука: http://www.coin-or.org/ ) и Berkeley UPC 
> (http://upc.lbl.gov/ ). Если его (Элмера) не опакетит кто-то раньше.

Ну давай вместе запилим, у меня вчера/сегодня в свободные минутки
вышло см. ниже.

Спеки есть в openSUSE'шных карманах, но там довольно странная
порезка на пачку _src_.rpm; дебиановская упаковка пока выглядит
более вменяемой при заданном виде upstream svn (стопка проектов
в подкаталогах одного корня).

elmergrid и elmerfem, собсно, не собрались (первый не нашёл
libmatc, второй -- libhuti; обе собраны в соседних каталогах
статиком).

http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/elmerfem-5.5.0-alt1svn4613.src.rpm
http://build.opensuse.org/search/search?search_text=elmerfem
http://packages.debian.org/elmer

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

Michael Shigorin пишет:
>> 5. ParaView www.paraview.org
> 
> С этим сложней (хотя будто не настолько, как с elmer):
> пока запоролся на cmake + libhdf5-devel и до возможности
> проверки кем-нить сведущим в OpenMPI выключил сборку обоих
> MPI-вариантов (плюс #24010).
> 
> 2 real: если будет минутка -- выложил перепотрошённый федорин:
> http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/paraview-3.8.0-alt0.1.src.rpm

Не раньше, когда дойдут руки (ориентировочно пара-тройка недель).

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

Michael Shigorin пишет:
>>> 1. ElmerGUI,  http://www.csc.fi/english/pages/elmer
>> За это могу взяться я
[...]
> http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/elmerfem-5.5.0-alt1svn4613.src.rpm



-------- Исходное сообщение --------
Тема: [#29412] COMPLETE elmerfem.git=5.5.0-alt1.svn4645
Дата: Wed, 22 Sep 2010 08:13:35 +0400
От: Girar Builder robot <girar-builder@altlinux.org>
Отвечать: real@altlinux.org
Кому: Eugeny A. Rostovtsev <real@altlinux.org>
Копия: sisyphus-incominger@lists.altlinux.org

http://git.altlinux.org/tasks/archive/done/_28/29412/task/log

2010-Sep-22 07:47:01 :: task #29412 for sisyphus started by real:
#1 build 5.5.0-alt1.svn4645 from /people/real/packages/elmerfem.git
2010-Sep-22 07:47:02 :: [i586] #1 elmerfem.git 5.5.0-alt1.svn4645: 
build start
2010-Sep-22 07:47:02 :: [x86_64] #1 elmerfem.git 5.5.0-alt1.svn4645: 
build start
2010-Sep-22 08:04:54 :: [x86_64] #1 elmerfem.git 5.5.0-alt1.svn4645: 
build OK
2010-Sep-22 08:05:09 :: [i586] #1 elmerfem.git 5.5.0-alt1.svn4645: 
build OK
2010-Sep-22 08:05:13 :: build check OK
2010-Sep-22 08:05:17 :: noarch check OK
2010-Sep-22 08:05:18 :: plan OK
2010-Sep-22 08:05:18 :: version check OK
2010-Sep-22 08:06:04 :: created test repo
2010-Sep-22 08:06:08 :: dependencies check OK
2010-Sep-22 08:08:27 :: ELF symbols check OK
	x86_64: libelmerfem-devel=5.5.0-alt1.svn4645 post-install unowned files:
/usr/lib/elmersolver
	i586: libelmerfem-devel=5.5.0-alt1.svn4645 post-install unowned files:
/usr/lib/elmersolver
2010-Sep-22 08:10:11 :: install check OK
2010-Sep-22 08:10:12 :: gears inheritance check OK
2010-Sep-22 08:10:12 :: srpm inheritance check OK
girar-check-perms: access to elmerfem ALLOWED for real: project 
`elmerfem' is not listed in acl file for repository `sisyphus'
2010-Sep-22 08:10:12 :: acl check OK
2010-Sep-22 08:10:13 :: packages update OK
2010-Sep-22 08:10:13 :: repo update OK
2010-Sep-22 08:12:41 :: contents_index update OK
2010-Sep-22 08:12:48 :: created /gears/e/elmerfem.git branch `sisyphus'
2010-Sep-22 08:12:50 :: gears update OK
2010-Sep-22 08:12:50 :: ACL for new project `elmerfem' assigned to 
user `real'
2010-Sep-22 08:13:35 :: task #29412 for sisyphus COMPLETE


-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

REAL пишет:
> #1 build 5.5.0-alt1.svn4645 from /people/real/packages/elmerfem.git

Да, пока ElmerGUI собран без VTK (и, как следствие, без OpenCASCADE), 
нужно будет разбобраться, с какого перепугу с VTK оно валится с 
segfault, а это небыстро.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

Michael Shigorin пишет:
>>>>> 1. ElmerGUI,  http://www.csc.fi/english/pages/elmer
>>>> За это могу взяться я
>>> http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/elmerfem-5.5.0-alt1svn4613.src.rpm
>> #1 build 5.5.0-alt1.svn4645 from /people/real/packages/elmerfem.git
> 
> Ну даёшь.

Что-то не так?

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Wed, Sep 22, 2010 at 11:24:39AM +0800, REAL wrote:
> >>>1. ElmerGUI,  http://www.csc.fi/english/pages/elmer
> >>За это могу взяться я
> >http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/elmerfem-5.5.0-alt1svn4613.src.rpm
> #1 build 5.5.0-alt1.svn4645 from /people/real/packages/elmerfem.git

Ну даёшь.

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Wed, Sep 22, 2010 at 02:39:32PM +0800, REAL wrote:
> >>>>>1. ElmerGUI,  http://www.csc.fi/english/pages/elmer
> >>>>За это могу взяться я
> >>>http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/elmerfem-5.5.0-alt1svn4613.src.rpm
> >>#1 build 5.5.0-alt1.svn4645 from /people/real/packages/elmerfem.git
> >Ну даёшь.
> Что-то не так?

Да не -- припоминая, как застрял :)

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Alexey Piguzov]

> 1. ElmerGUI, http://sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/elmerfem
> 2. XCrysDen, http://sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/xcrysden
> 3. OpenCASCADE http://sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/opencascade
> 4. GnuPlot http://sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/gnuplot
> 5. ParaView -- ?
>

>
> С уважением Алексей
>

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Mon, Sep 27, 2010 at 04:10:49PM +0400, Alexey Piguzov wrote:
> 5. ParaView -- ?

http://lists.altlinux.org/pipermail/sisyphus/2010-September/348922.html

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

Alexey Piguzov пишет:
>> 5. ParaView -- ?

Этот пока ожидает опакечивания всего необходимого и лечения того, что 
уже есть.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

Gleb Kulikov пишет:
>> Советую Вам создать запрос в багзилле по каждому из необходимых
> 
> Между прочим, есть чудный ресурс http://fap.sbras.ru/ (обратите внимание, в 
> качестве корпоративной сборки выбрана Убунту). Возможно, уважаемым 
> мэйнтейнерам стоило бы рассмотреть вопрос о некоторой синхронизации того что 
> есть у нас?

А зачем? "Чтобы было"? На мой взгляд, "создать запрос в багзилле по 
каждому из необходимых" является более приемлемым вариантом.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Gleb Kulikov]

В сообщении от [Воскресенье 30 мая 2010 Радик Юсупов] написал:

> Советую Вам создать запрос в багзилле по каждому из необходимых

Между прочим, есть чудный ресурс http://fap.sbras.ru/ (обратите внимание, в 
качестве корпоративной сборки выбрана Убунту). Возможно, уважаемым 
мэйнтейнерам стоило бы рассмотреть вопрос о некоторой синхронизации того что 
есть у нас?



-- 
      Салют, /GLeb

UIN: 15341920
jabber://gleb@asd.iao.ru
sip://2387245@sipnet.ru			(telephony)
skype://gleb_kulikov.tomsk		(telephony)

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Wed, Oct 06, 2010 at 10:42:30AM +0700, Gleb Kulikov wrote:
> > Советую Вам создать запрос в багзилле по каждому из необходимых
> Между прочим, есть чудный ресурс http://fap.sbras.ru/ (обратите
> внимание, в качестве корпоративной сборки выбрана Убунту).

Если "для среднестатистического мнс", то "(международные
проекты-лидеры Ubuntu и Fedora Linux)" понятны -- а если
$subject, то я их на кластерах не наблюдаю.

Имеет ли отношение?

> Возможно, уважаемым мэйнтейнерам стоило бы рассмотреть вопрос
> о некоторой синхронизации того что есть у нас?

Поясни, не понял.

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

Gleb Kulikov пишет:
>>> Между прочим, есть чудный ресурс http://fap.sbras.ru/ (обратите
>>> внимание, в качестве корпоративной сборки выбрана Убунту).
>> Если "для среднестатистического мнс", то "(международные
>> проекты-лидеры Ubuntu и Fedora Linux)" понятны -- а если
>> $subject, то я их на кластерах не наблюдаю.
>>
>> Имеет ли отношение?
> 
> Дело не в кластерах, дело в позициях дистрибутива. Вряд ли "покинуть ещё одну 
> нишу" это сильно хорошо.

Видите ли, можно дать вот такой адрес - 
http://www.gnu.org/software/software.html - и сказать, что если мы 
хотим быть крутыми, в ALT нужно собрать всё, что там есть.

Но так ли это? Если у приложения нет пользователей, зачем его вообще 
собирать? Другое дело, когда называют имена конкретных пакетов, 
которые нужны (и пара слов - зачем), и у кого-то из team может 
появиться интерес собрать это что-нибудь.

А так - нет, неинтересно.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

Gleb Kulikov пишет:
> Любой линукс сейчас имеет хоть на "вот столько"  прочные позиции ровно в трёх 
> ареалах (не считая сервисов, конечно, но это совсем другая история) --- 
> программисткой тусовке, научном сообществе и среди "гиков". Всё.
> Выпадение из одного (из трёх!) множеств, довольно неприятно... кажется.
> И вовсе не надо "тащить к себе всё", необходимо и достаточно самое 
> востребованное и популярное.

Так вот ведь и вопрос такой стоит: что, по Вашему мнению, является 
"самым востребованным и популярным" из той ссылки, что тут пробегала? 
И если этого ещё нет в сизифе, чем не устраивают [возможные] 
альтернативы, которые в сизифе вполне могут быть?

Т.е. слишком абстрактная пока тема, зацепиться не за что.

> особенность научной тусовки в том, что люди интересуются 
> софтвером постольку, поскольку. Нажать кнопку в синаптика это одно, сделать 
> заказ --- не уверен.

Особенность научной тусовки в том, что если чего-то не хватает, 
начинаются вопросы, где взять софт, который может "вот это". Если не 
находится, пишется самостоятельно. Я пока не понял, что конкретно 
востребовано, но у нас этого нет.

PS. Я вот уже скоро как пару лет занимаюсь наполнением сизифа научным 
софтом, но не всё подряд, а исходя из запросов местной тусовки или 
рассылок ALT. Учитывая и кривизну (как пример, были сильные просьбы 
собрать OpenFOAM, но я этого не стану делать даже под пытками, ибо 
возня с OpenFOAM похуже всяких пыток).

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Gleb Kulikov]

В сообщении от [Среда 06 октября 2010 Michael Shigorin] написал:

> > Между прочим, есть чудный ресурс http://fap.sbras.ru/ (обратите
> > внимание, в качестве корпоративной сборки выбрана Убунту).
> 
> Если "для среднестатистического мнс", то "(международные
> проекты-лидеры Ubuntu и Fedora Linux)" понятны -- а если
> $subject, то я их на кластерах не наблюдаю.
> 
> Имеет ли отношение?

Дело не в кластерах, дело в позициях дистрибутива. Вряд ли "покинуть ещё одну 
нишу" это сильно хорошо.

> 
> > Возможно, уважаемым мэйнтейнерам стоило бы рассмотреть вопрос
> > о некоторой синхронизации того что есть у нас?
> 
> Поясни, не понял.

Вопрос к ареалу обитания. Тем паче, что пакеты уже обкатаны и вряд ли 
поддержание их у нас может отъесть много ресурсов.

-- 
      Салют, /GLeb

UIN: 15341920
jabber://gleb@asd.iao.ru
sip://2387245@sipnet.ru			(telephony)
skype://gleb_kulikov.tomsk		(telephony)

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Gleb Kulikov]

В сообщении от [Среда 06 октября 2010 REAL] написал:

> Gleb Kulikov пишет:
> >>> Между прочим, есть чудный ресурс http://fap.sbras.ru/ (обратите
> > Дело не в кластерах, дело в позициях дистрибутива. Вряд ли "покинуть ещё
> > одну нишу" это сильно хорошо.
> 
> Видите ли, можно дать вот такой адрес -
> http://www.gnu.org/software/software.html - и сказать, что если мы
> хотим быть крутыми, в ALT нужно собрать всё, что там есть.

Нет, не так. 
Любой линукс сейчас имеет хоть на "вот столько"  прочные позиции ровно в трёх 
ареалах (не считая сервисов, конечно, но это совсем другая история) --- 
программисткой тусовке, научном сообществе и среди "гиков". Всё.
Выпадение из одного (из трёх!) множеств, довольно неприятно... кажется.
И вовсе не надо "тащить к себе всё", необходимо и достаточно самое 
востребованное и популярное.

> Но так ли это? Если у приложения нет пользователей, зачем его вообще
> собирать? Другое дело, когда называют имена конкретных пакетов,

Всё правильно. Но особенность научной тусовки в том, что люди интересуются 
софтвером постольку, поскольку. Нажать кнопку в синаптика это одно, сделать 
заказ --- не уверен.


-- 
      Салют, /GLeb

UIN: 15341920
jabber://gleb@asd.iao.ru
sip://2387245@sipnet.ru			(telephony)
skype://gleb_kulikov.tomsk		(telephony)

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Wed, Oct 06, 2010 at 05:33:50PM +0700, Gleb Kulikov wrote:
> > > Между прочим, есть чудный ресурс http://fap.sbras.ru/ (обратите
> > > внимание, в качестве корпоративной сборки выбрана Убунту).
> > Если "для среднестатистического мнс", то "(международные
> > проекты-лидеры Ubuntu и Fedora Linux)" понятны -- а если
> > $subject, то я их на кластерах не наблюдаю.
> > Имеет ли отношение?
> Дело не в кластерах, дело в позициях дистрибутива.
> Вряд ли "покинуть ещё одну нишу" это сильно хорошо.

Тут всё забавней, но всему своё время.  И -- не переживай :-)

> > > Возможно, уважаемым мэйнтейнерам стоило бы рассмотреть вопрос
> > > о некоторой синхронизации того что есть у нас?
> > Поясни, не понял.
> Вопрос к ареалу обитания. Тем паче, что пакеты уже обкатаны и
> вряд ли поддержание их у нас может отъесть много ресурсов.

Расширение (и сужение) пакетной и пользовательской базы --
процессы взаимосвязанные, но первично всё-таки последнее.

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

Радик Юсупов пишет:
>> Дело не в кластерах, дело в позициях дистрибутива. Вряд ли "покинуть 
>> ещё одну
>> нишу" это сильно хорошо.
>>
> А вы все-таки повесьте запрос как я Вас попросил.
> Дело в том, что это может быть не интересно _сообществу_, но интересно 
> ООО "АльтЛинукс" и они соберут это ПО и будут поддерживать :)

Повторюсь, что лучше всего весить по одному запросу на каждый пакет 
(со ссылками на описание). Так будет более вероятно, что что-то из 
пакетов вызовет интерес.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Радик Юсупов]

  06.10.2010 14:33, Gleb Kulikov пишет:
> В сообщении от [Среда 06 октября 2010 Michael Shigorin] написал:
>
>>> Между прочим, есть чудный ресурс http://fap.sbras.ru/ (обратите
>>> внимание, в качестве корпоративной сборки выбрана Убунту).
>> Если "для среднестатистического мнс", то "(международные
>> проекты-лидеры Ubuntu и Fedora Linux)" понятны -- а если
>> $subject, то я их на кластерах не наблюдаю.
>>
>> Имеет ли отношение?
> Дело не в кластерах, дело в позициях дистрибутива. Вряд ли "покинуть ещё одну
> нишу" это сильно хорошо.
>
А вы все-таки повесьте запрос как я Вас попросил.
Дело в том, что это может быть не интересно _сообществу_, но интересно 
ООО "АльтЛинукс" и они соберут это ПО и будут поддерживать :)


-- 
С уважением, инженер отдела ИИС ООО «Центр»
Юсупов Радик Анасович
Usupov.Radik@cg.ru
Тел: (843) 533-88-14 (внут: 1811)
ICQ: 271639884
Jabber: radyus@jabber.ru
Skype: Radik.Usupov
Ekiga: radyus@ekiga.net

Российская Федерация
Казань, ул. Зинина, 3а
420029, а/я 81

http://www.cg.ru/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Радик Юсупов]

  07.10.2010 09:05, REAL пишет:
> Радик Юсупов пишет:
>>> Дело не в кластерах, дело в позициях дистрибутива. Вряд ли "покинуть 
>>> ещё одну
>>> нишу" это сильно хорошо.
>>>
>> А вы все-таки повесьте запрос как я Вас попросил.
>> Дело в том, что это может быть не интересно _сообществу_, но 
>> интересно ООО "АльтЛинукс" и они соберут это ПО и будут поддерживать :)
>
> Повторюсь, что лучше всего весить по одному запросу на каждый пакет 
> (со ссылками на описание). Так будет более вероятно, что что-то из 
> пакетов вызовет интерес.
>
Абсолютно поддерживаю.

-- 
Ведущий инженер ООО "Центр"
ALTLinux Team
Jabber: radyus@jabber.ru

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

2 mike@:

> Michael Shigorin пишет:
>>> 5. ParaView www.paraview.org
>>
>> С этим сложней (хотя будто не настолько, как с elmer):
>> пока запоролся на cmake + libhdf5-devel и до возможности
>> проверки кем-нить сведущим в OpenMPI выключил сборку обоих
>> MPI-вариантов (плюс #24010).
>>
>> 2 real: если будет минутка -- выложил перепотрошённый федорин:
>> http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/paraview-3.8.0-alt0.1.src.rpm

Ну у нас ParaView без MPI не имеет смысла (ибо ему нужен VTK, которому 
нужен OpenMPI). Сборка уже проходит, осталось разобраться с установкой 
и небольшой проверкой в работе. Надеюсь, на следующей неделе уже будет 
в Сизифе.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

06.09.2010 10:35, REAL пишет:
> Michael Shigorin пишет:
>>> 5. ParaView www.paraview.org
>>
>> С этим сложней (хотя будто не настолько, как с elmer):
>> пока запоролся на cmake + libhdf5-devel и до возможности
>> проверки кем-нить сведущим в OpenMPI выключил сборку обоих
>> MPI-вариантов (плюс #24010).
>>
>> 2 real: если будет минутка -- выложил перепотрошённый федорин:
>> http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/paraview-3.8.0-alt0.1.src.rpm

http://git.altlinux.org/tasks/archive/done/_32/32841/task/log.1.2

Собран с OpenMPI.

Если будут запросы сделать сборку совсем без MPI, сделаю отдельным 
пакетом (скажем, paraview-serial).

PS. Кстати, апстрима нужно на мыло извести.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Alexey Piguzov]

Около полугода назад я обращался с просьбой собрать для учебного
процесса следующие пакеты, что собственно и было сделано. Большая
благодарность за труд!
> 1. ElmerGUI, http://sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/elmerfem
> 2. XCrysDen, http://sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/xcrysden
> 3. OpenCASCADE http://sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/opencascade
> 4. GnuPlot http://sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/gnuplot
> 5. ParaView http://sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/paraview
Вопрос в следующем, почти все эти программы находятся в Сизифе, а
класс у меня обновляется с р5. Можно ли мне поставить прямо из Сизифа
эти программы и что это может сломать?
Или нужно их пересобирать в р5?
Спасибо!

17.11.10, REAL<root@mmedia2.kemsu.ru> написал(а):
> 06.09.2010 10:35, REAL пишет:
>> Michael Shigorin пишет:
>>>> 5. ParaView www.paraview.org
>>>
>>> С этим сложней (хотя будто не настолько, как с elmer):
>>> пока запоролся на cmake + libhdf5-devel и до возможности
>>> проверки кем-нить сведущим в OpenMPI выключил сборку обоих
>>> MPI-вариантов (плюс #24010).
>>>
>>> 2 real: если будет минутка -- выложил перепотрошённый федорин:
>>> http://fly.osdn.org.ua/~mike/tmp/paraview-3.8.0-alt0.1.src.rpm
>
> http://git.altlinux.org/tasks/archive/done/_32/32841/task/log.1.2
>
> Собран с OpenMPI.
>
> Если будут запросы сделать сборку совсем без MPI, сделаю отдельным
> пакетом (скажем, paraview-serial).
>
> PS. Кстати, апстрима нужно на мыло извести.
>
> --
>
> REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ
> _______________________________________________
> Sisyphus mailing list
> Sisyphus@lists.altlinux.org
> https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/sisyphus

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Fri, Jan 14, 2011 at 10:32:54PM +0300, Alexey Piguzov wrote:
> Вопрос в следующем, почти все эти программы находятся в Сизифе,
> а класс у меня обновляется с р5. Можно ли мне поставить прямо
> из Сизифа эти программы и что это может сломать?  Или нужно их
> пересобирать в р5?

Нужно пересобирать, причём часть может не пересобраться
(где-то был питон).

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

15.01.2011 03:39, Michael Shigorin пишет:
>> Вопрос в следующем, почти все эти программы находятся в Сизифе,
>> а класс у меня обновляется с р5. Можно ли мне поставить прямо
>> из Сизифа эти программы и что это может сломать?  Или нужно их
>> пересобирать в р5?
>
> Нужно пересобирать, причём часть может не пересобраться
> (где-то был питон).

да там массу пакетов нужно будет предварительно впендюрить или 
обновить. и только потом браться за ParaView и ElmerGUI. работа не для 
слабонервных и сильно занятых :(

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[andriy]

  On 15.01.11 00:09, REAL wrote:
> 15.01.2011 03:39, Michael Shigorin пишет:
>>> Вопрос в следующем, почти все эти программы находятся в Сизифе,
>>> а класс у меня обновляется с р5. Можно ли мне поставить прямо
>>> из Сизифа эти программы и что это может сломать?  Или нужно их
>>> пересобирать в р5?
>>
>> Нужно пересобирать, причём часть может не пересобраться
>> (где-то был питон).
>
> да там массу пакетов нужно будет предварительно впендюрить или 
> обновить. и только потом браться за ParaView и ElmerGUI. работа не для 
> слабонервных и сильно занятых :(
>
Желательно бы и SLURM версии 2.2.

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Sat, Jan 15, 2011 at 04:09:16AM +0600, REAL wrote:
> >>Вопрос в следующем, почти все эти программы находятся в
> >>Сизифе, а класс у меня обновляется с р5. Можно ли мне
> >>поставить прямо из Сизифа эти программы и что это может
> >>сломать?  Или нужно их пересобирать в р5?
> >Нужно пересобирать, причём часть может не пересобраться
> >(где-то был питон).
> да там массу пакетов нужно будет предварительно впендюрить или
> обновить. и только потом браться за ParaView и ElmerGUI. работа
> не для слабонервных и сильно занятых :(

Так что скорее сизифный чрут (как вариант, hsh-run).

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Sat, Jan 15, 2011 at 10:54:31AM +0200, andriy wrote:
> Желательно бы и SLURM версии 2.2.

У Вас 2.0 уже используется или только предполагаете?

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[andriy]

  On 15.01.11 11:13, Michael Shigorin wrote:
> On Sat, Jan 15, 2011 at 10:54:31AM +0200, andriy wrote:
>> Желательно бы и SLURM версии 2.2.
> У Вас 2.0 уже используется или только предполагаете?
>
Предполагаю. Просто в 2.2 есть поддержка GPU:

https://computing.llnl.gov/linux/slurm/gres.html

С led@ связывался, но он пакеты в Сизифе не поддерживает.

Интересно бы самому попытаться собрать   ...как и CUDA_SDK в rpm-пакет.

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Sat, Jan 15, 2011 at 11:17:21AM +0200, andriy wrote:
> >>Желательно бы и SLURM версии 2.2.
> >У Вас 2.0 уже используется или только предполагаете?
> Предполагаю.

Тогда лучше обождите.

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[andriy]

  On 15.01.11 14:34, Michael Shigorin wrote:
> On Sat, Jan 15, 2011 at 11:17:21AM +0200, andriy wrote:
>>>> Желательно бы и SLURM версии 2.2.
>>> У Вас 2.0 уже используется или только предполагаете?
>> Предполагаю.
> Тогда лучше обождите.
Ок. Тем более пока разбираюсь с PBS.

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Alexey Piguzov]

15.01.11, Michael Shigorin<mike@osdn.org.ua> написал(а):
> On Sat, Jan 15, 2011 at 04:09:16AM +0600, REAL wrote:
>> >>Вопрос в следующем, почти все эти программы находятся в
>> >>Сизифе, а класс у меня обновляется с р5. Можно ли мне
>> >>поставить прямо из Сизифа эти программы и что это может
>> >>сломать?  Или нужно их пересобирать в р5?
>> >Нужно пересобирать, причём часть может не пересобраться
>> >(где-то был питон).
>> да там массу пакетов нужно будет предварительно впендюрить или
>> обновить. и только потом браться за ParaView и ElmerGUI. работа
>> не для слабонервных и сильно занятых :(
>
> Так что скорее сизифный чрут (как вариант, hsh-run).
>
> --
>  ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
>   ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Из всего этого я понял, да ничего что-то не понял, и кто такой
сизифный чрут (прямо как чёрт звучит блин).
Скорее всего можно попробовать обновиться, но не стоит, так?

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Sergei Epiphanov]

В сообщении от 17 января 2011 14:39:29 автор Alexey Piguzov написал:
> Из всего этого я понял, да ничего что-то не понял, и кто такой
> сизифный чрут (прямо как чёрт звучит блин).

Использовать команду chroot и в качестве дополнительной системы использовать 
Сизиф. Его можно как руками сделать (у apt-get есть параметры -o Dir и        
-o RPM::RootDir , у rpm есть --root)  или сделать посредством hsh и запускать 
программы там при помощи hsh-run.

> Скорее всего можно попробовать обновиться, но не стоит, так?

Обновляться придётся до Сизифа, чего вам не советуют (всё-таки Сизиф больше 
для разработчиков, а не для рабочих систем с минимально возможным простоем).

-- 
С уважением, Епифанов Сергей

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[REAL]

17.01.2011 17:39, Alexey Piguzov пишет:
> Из всего этого я понял, да ничего что-то не понял, и кто такой
> сизифный чрут (прямо как чёрт звучит блин).
> Скорее всего можно попробовать обновиться, но не стоит, так?

Можно обновиться до сизифа, если это нужно очень срочно. Иначе 
дождаться появления бранча 6.0.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Michael Shigorin]

On Mon, Jan 17, 2011 at 02:39:29PM +0300, Alexey Piguzov wrote:
> >> да там массу пакетов нужно будет предварительно впендюрить или
> >> обновить. и только потом браться за ParaView и ElmerGUI. работа
> >> не для слабонервных и сильно занятых :(
> > Так что скорее сизифный чрут (как вариант, hsh-run).
> Из всего этого я понял, да ничего что-то не понял, и кто такой
> сизифный чрут (прямо как чёрт звучит блин).

sisyphus chroot :)

Про chroot прочитайте в любой книжке про юникс (или отправьте
студента почитать), а наиболее удобно сделать его из Sisyphus
можно с помощью утилиты hsh-initroot из пакета hasher; удобно
воспользоваться результатом -- пресловутым hsh-run оттуда же.

> Скорее всего можно попробовать обновиться, но не стоит, так?

Можете взять одну рабочую станцию и попробовать обновить её
(либо взять бету Centaurus на beta.altlinux.ru и установить
на N+1-ю машинку, затем подключить Sisyphus и поставить нужные
пакеты).

Бэкпортить те сборки на p5 действительно слишком дорого.

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [sisyphus] Программы для вычислительного кластера

[Alexey Piguzov]

Спасибо за пояснения, будем разбираться... Чем chroot не шутит вдруг
получится чего-нибудь...

17.01.11, Michael Shigorin<mike@osdn.org.ua> написал(а):
> On Mon, Jan 17, 2011 at 02:39:29PM +0300, Alexey Piguzov wrote:
>> >> да там массу пакетов нужно будет предварительно впендюрить или
>> >> обновить. и только потом браться за ParaView и ElmerGUI. работа
>> >> не для слабонервных и сильно занятых :(
>> > Так что скорее сизифный чрут (как вариант, hsh-run).
>> Из всего этого я понял, да ничего что-то не понял, и кто такой
>> сизифный чрут (прямо как чёрт звучит блин).
>
> sisyphus chroot :)
>
> Про chroot прочитайте в любой книжке про юникс (или отправьте
> студента почитать), а наиболее удобно сделать его из Sisyphus
> можно с помощью утилиты hsh-initroot из пакета hasher; удобно
> воспользоваться результатом -- пресловутым hsh-run оттуда же.
>
>> Скорее всего можно попробовать обновиться, но не стоит, так?
>
> Можете взять одну рабочую станцию и попробовать обновить её
> (либо взять бету Centaurus на beta.altlinux.ru и установить
> на N+1-ю машинку, затем подключить Sisyphus и поставить нужные
> пакеты).
>
> Бэкпортить те сборки на p5 действительно слишком дорого.
>
> --
>  ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
>   ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/
> _______________________________________________
> Sisyphus mailing list
> Sisyphus@lists.altlinux.org
> https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/sisyphus