[Comm] Медициснкие приложения

[Comm] Медициснкие приложения

[anyr]

По аналогии с DebianMed (http://debian-med.alioth.debian.org) попытаюсь 
описать список имеющихся в репозиториях ALT Linux, или необходимых 
приложений, полезных в работе медицинских работников для последующего 
выкладывания на wiki (если не будет возражений). Хотел бы услышать мнение о 
целесообразности этого.

Работа с медицинскими изображениями
-----------------------------------
На http://www.idoimaging.com/ есть список приложений с рейтингом для работы 
с DICOM, им я и руководствовался при выборе приложений для упаковки.

DCMTK набор приложений и библиотек для отображения DICOM.
http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/dcmtk

Volpack набор библиотек для обработки объемных изображений. Собрана криво с 
ELF silent.
http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/volpack

Aeskulap  - приложение для просмотра изображений DICOM на основе DCMTK. Есть 
возможность просмотра изображений из PACS архива, поддерживается dicomdir.
Работа с dicomdir реализована, однако у нас работает отчасти. Вся проблема в 
том, что некоторые рабочие станции записывают в dicomdir ссылки на файлы 
изображений в верхнем регистре, в то время как на диске имена этих файлов в 
нижнем регистре. Для windows это не критично, для linux — это разные файлы. 
Как побороть пока не знаю.
http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/aeskulap

XmedCon приложение для просмотра DICOM. Имеет большое количество фильтров и 
поддержку большого количества форматов. DICOMDIR не поддерживает.
http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/xmedcon

Amide — инструмент для просмотра и анализа комплектов данных медицинских 
изображений. Он позволяет выполнять одновременную обработку сложных 
комплектов данных, импортируемых из множества форматов файлов, слияние 
изображений, вывод и анализ интересующей трёхмерной области, визуализация 
объёмов и взаимное выравнивание снимков твёрдых тел. 
http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/amide

ImageJ — Программа для анализа научных изображений, в том числе и DICOM. Ее 
нет в репозиториях, но она написана на Java и может использована в том виде, 
в котором её распространяют разработчики.
http://rsb.info.nih.gov/ij/

Slicer3d — программа для трехмерной реконструкции КТ и МРТ. На сайте 
разработчика есть бинарная сборка, которая запускается под ALT. Есть и 
исходники. Но приступать к их сборке мне просто страшно.
http://www.slicer.org/

Химия и фармакология
--------------------

ChemTool – Программа для рисования химических формул.
http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/chemtool

Справочник лекарственных средств
Использую диск Видаль, доставшийся мне вместе с бумажной версией 
справочника. В firefox он отображается некорректно и не работает поиск, зато 
правильно отображается и работает поиск в chromium.
http://www.vidal.ru/poisk_preparatov/

Организация здравоохранения
---------------------------
Как сказано на debianmed, тут должны быть пакеты, которые полезны для 
построения системы управления информационным наполнением в области 
здравоохранения и в ALT таких пакетов нет. Я могу ошибаться, но пользы от 
таких программ может оказаться не много, поскольку труд на приведение их к 
местным реалиям будет сопоставим с написанием новых приложений.

Прочее
------

OpenMedSpell – проверка орфографии в медицинской терминологии. Можно скачать 
словарь у разработчика. Может быть имеет смысл его завернуть в пакет.
http://www.e-medtools.com/openmedspel.html

Для русского языка словаря медицинских терминов пока нет. Кое что пытаюсь 
сделать самостоятельно, но времени свободного не так много и процесс идет 
медленно.

Медицинские словари dict, stardic
Существуют честно украденные словари от 11 Lingvo преобразованные для работы 
с stardict

Ересь
-----
Не вижу смысла вносить в этот список программы типа mencal (календарь 
менструального цикла), хотя на DebianMed они есть.

-- 
Andrey Yurkovsky

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[anyr]

С темой я облажался. Имелись в виду "Медицинские приложения" :)
-- 
Andrey Yurkovsky

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[Eugene Prokopiev]

> Хотел бы услышать мнение о целесообразности этого

Целесообразность, разумеется, есть. Но вопрос в потребности. Если она
реальна, то и спецдистрибутив с подборкой медицинских программ сделать
недолго.

-- 
С уважением,
Прокопьев Евгений

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[Aleksey Novodvorsky]

15 марта 2010 г. 7:52 пользователь Eugene Prokopiev <enp@altlinux.org> написал:
>> Хотел бы услышать мнение о целесообразности этого
>
> Целесообразность, разумеется, есть. Но вопрос в потребности. Если она
> реальна, то и спецдистрибутив с подборкой медицинских программ сделать
> недолго.

У нас в тим есть практикующий хирург и специалист по медицинскому ПО
jaa@. Давайте у него спросим.

Rgrds, Алексей

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[Андрей Черепанов]

14 марта 2010 anyr@tut.by написал:
> По аналогии с DebianMed (http://debian-med.alioth.debian.org) попытаюсь
> описать список имеющихся в репозиториях ALT Linux, или необходимых
> приложений, полезных в работе медицинских работников для последующего
> выкладывания на wiki (если не будет возражений). Хотел бы услышать мнение о
> целесообразности этого.
Выкладывайте на Wiki.

-- 
Андрей Черепанов
ALT Linux
cas@altlinux.ru

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[Denis Nazarov]

В сообщении от Понедельник 15 марта 2010 10:11:24 автор Aleksey Novodvorsky 
написал:
> 15 марта 2010 г. 7:52 пользователь Eugene Prokopiev <enp@altlinux.org> 
написал:
> >> Хотел бы услышать мнение о целесообразности этого
> >
> > Целесообразность, разумеется, есть. Но вопрос в потребности. Если она
> > реальна, то и спецдистрибутив с подборкой медицинских программ сделать
> > недолго.
> 
> У нас в тим есть практикующий хирург и специалист по медицинскому ПО
> jaa@. Давайте у него спросим.
> 

в свете последних новостей может оказаться нужным и целесообразным 
http://www.rbcdaily.ru/2010/03/15/media/464380

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[Алексей Шенцев]

14.03.2010 23:37, anyr@tut.by пишет:
> По аналогии с DebianMed (http://debian-med.alioth.debian.org) попытаюсь 
> описать список имеющихся в репозиториях ALT Linux, или необходимых 
> приложений, полезных в работе медицинских работников для последующего 
> выкладывания на wiki (если не будет возражений). Хотел бы услышать мнение о 
> целесообразности этого.
>   
Такое

http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_open_source_healthcare_software
http://www.goomedic.com/20-linux-open-source-emr-ehr-and-his-hospital-information-system-applications.html
http://rus-linux.net/po.php?name=po/po-12.koi

смотрели?

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[anyr]

Алексей Шенцев wrote:

> Такое
> 
> http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_open_source_healthcare_software
> http://www.goomedic.com/20-linux-open-source-emr-ehr-and-his-hospital-
information-system-applications.html
> http://rus-linux.net/po.php?name=po/po-12.koi
> 
> смотрели?
> 
Я же не обзор приложений писать пытаюсь, я хотел список приложений, которые 
есть в репозиториях ALT описать, а заодно определится, чего в нем не 
хватает.
-- 
Andrey Yurkovsky

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[Алексей Шенцев]

15.03.2010 23:31, anyr@tut.by пишет:
> Я же не обзор приложений писать пытаюсь,
А кто говорит про обзор? :)
> я хотел список приложений, которые 
> есть в репозиториях ALT описать,
Вы достаточно чётко это обозначили изначально.
>  а заодно определится, чего в нем не хватает.
>   
Вот я и привёл Вам ссылки на посмотреть ... ;)

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[anyr]

Алексей Шенцев wrote:

> Вот я и привёл Вам ссылки на посмотреть ... ;)
Хм, разговор вышел как-то не очень.

Хотел я сказать следующее: программ очень много. Но далеко не во всех есть 
нужда, а если нет в программе нужды, а это не мой профиль, то как я проверю 
её работоспособность? Наверно будет маньячеством собирать все, что будет 
близко к медицине, абы было, а оно потом будет лежать мертвым грузом.

-- 
Andrey Yurkovsky

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[anyr]

anyr@tut.by wrote:

> а если нет в программе нужды, а это не мой профиль
а если нет в программе нужды, И это не мой профиль
-- 
Andrey Yurkovsky

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[Michael Shigorin]

On Mon, Mar 15, 2010 at 07:52:54AM +0300, Eugene Prokopiev wrote:
> > Хотел бы услышать мнение о целесообразности этого
> Целесообразность, разумеется, есть. Но вопрос в потребности.
> Если она реальна, то и спецдистрибутив с подборкой медицинских
> программ сделать недолго.

Ага.


On Mon, Mar 15, 2010 at 11:37:39AM +0300, Андрей Черепанов wrote:
> > По аналогии с DebianMed (http://debian-med.alioth.debian.org)
> > попытаюсь описать список имеющихся в репозиториях ALT Linux,
> > или необходимых приложений, полезных в работе медицинских
> > работников для последующего выкладывания на wiki (если не
> > будет возражений). Хотел бы услышать мнение о
> > целесообразности этого.
> Выкладывайте на Wiki.

Угу.

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] Медициснкие приложения

[Andrey Yurkovsky]

Michael Shigorin wrote:

> On Mon, Mar 15, 2010 at 07:52:54AM +0300, Eugene Prokopiev wrote:
>> > Хотел бы услышать мнение о целесообразности этого
>> Целесообразность, разумеется, есть. Но вопрос в потребности.
>> Если она реальна, то и спецдистрибутив с подборкой медицинских
>> программ сделать недолго.
> 
> Ага.
Не знаю стоит ли. Вполне можно обойтись метапакетами.
> 
> On Mon, Mar 15, 2010 at 11:37:39AM +0300, Андрей Черепанов wrote:
>> > По аналогии с DebianMed (http://debian-med.alioth.debian.org)
>> > попытаюсь описать список имеющихся в репозиториях ALT Linux,
>> > или необходимых приложений, полезных в работе медицинских
>> > работников для последующего выкладывания на wiki (если не
>> > будет возражений). Хотел бы услышать мнение о
>> > целесообразности этого.
>> Выкладывайте на Wiki.
> 
> Угу.
Так уже: http://www.altlinux.org/Медицина

-- 
Andrey Yurkovsky