From mboxrd@z Thu Jan  1 00:00:00 1970
Return-Path: <iadzhubey@rics.bwh.harvard.edu>
Date: Tue, 25 Apr 2006 00:38:47 -0400
From: Ivan Adzhubey <iadzhubey@rics.bwh.harvard.edu>
In-reply-to: <20060425042247.GU8441@localhost>
To: ALT Linux Sisyphus discussion list <sisyphus@lists.altlinux.org>
Message-id: <200604250038.47814.iadzhubey@rics.bwh.harvard.edu>
MIME-version: 1.0
Content-type: text/plain; charset=koi8-r
Content-transfer-encoding: 8BIT
Content-disposition: inline
References: <200604242256.51166.iadzhubey@rics.bwh.harvard.edu>
	<200604250015.41866.iadzhubey@rics.bwh.harvard.edu>
	<20060425042247.GU8441@localhost>
User-Agent: KMail/1.9.1
Subject: Re: [sisyphus] binutils problem?
X-BeenThere: sisyphus@lists.altlinux.org
X-Mailman-Version: 2.1.7
Precedence: list
Reply-To: ALT Linux Sisyphus discussion list <sisyphus@lists.altlinux.org>
List-Id: ALT Linux Sisyphus discussion list <sisyphus.lists.altlinux.org>
List-Unsubscribe: <https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/sisyphus>,
	<mailto:sisyphus-request@lists.altlinux.org?subject=unsubscribe>
List-Archive: <http://lists.altlinux.org/pipermail/sisyphus>
List-Post: <mailto:sisyphus@lists.altlinux.org>
List-Help: <mailto:sisyphus-request@lists.altlinux.org?subject=help>
List-Subscribe: <https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/sisyphus>,
	<mailto:sisyphus-request@lists.altlinux.org?subject=subscribe>
X-List-Received-Date: Tue, 25 Apr 2006 04:39:06 -0000
Archived-At: <http://lore.altlinux.org/sisyphus/200604250038.47814.iadzhubey@rics.bwh.harvard.edu/>
List-Archive: <http://lore.altlinux.org/sisyphus/>
List-Post: <mailto:sisyphus@altlinux.ru>

On Tuesday 25 April 2006 00:22, Alexey Tourbin wrote:
> On Tue, Apr 25, 2006 at 12:15:41AM -0400, Ivan Adzhubey wrote:
> > > > Надо править configure скрипты?
> > >
> > > Это в configure??? Видимо, таки править. Топором причем.
> >
> > Не пришлось, с libgoto пересобраной с -lm ./configure отработал без сбоев
> > и R собрался нормально. Значит все же в этом было дело. Спасибо огромное
> > за помощь!
>
> Вы R собираете? А почему не с lapack'ом?  Я на R в ноябре собаку съел. 
> Сейчас R-1.9 лежит в orphaned, скоро буду собирать R-2.2.

Собрал, уже 2.3.0 вышел. Я его собираю с GotoBLAS, с lapack пока не пробовал, 
хотя из GotoBLAS можно собрать и оптимизированый lapack тоже. С 
оптимизированым BLAS ускорение векторных операций на P4 очень существенное, 
раза в три на некоторых задачах. Пробовал также ATLAS, но они сами признают, 
что до скоростных результатов творения Казушиге Гото им далеко, а процесс 
автоматической оптимизации там просто ужасный, на некоторых архитектурах 
сборка занимает двое суток. Наша наука подсела на R конкретно, без него как 
без рук. Очень было жаль, когда из Сизифа он пропал, но с другой стороны - я 
не представляю как с этими оптимизациями можно разобраться в общем виде, а 
без них - тоскливо. Так что все равно видимо придется собирать самому и 
дальше.

-- 
Иван