Re: [devel] [#238855] [test-only] FAILED R-base.git=3.6.1-alt1

Re: [devel] [#238855] [test-only] FAILED R-base.git=3.6.1-alt1

[Kirill Maslinsky]

Всем привет,

Кто-нибудь может подсказать, что случилось с BLAS на архитектуре i586?
Из-за этой ошибки уже несколько месяцев не пересобирается R, и,
соответственно, не выложить новую версию. 

Girar Builder awaiter robot writes:

> http://git.altlinux.org/tasks/238855/logs/events.1.1.log
>
> 2019-Oct-07 17:48:24 :: test-only task #238855 for sisyphus started by kirill:
> #100 build 3.6.1-alt1 from /people/kirill/packages/R-base.git fetched at 2019-Oct-07 17:48:23
> 2019-Oct-07 17:48:25 :: [x86_64] #100 R-base.git 3.6.1-alt1: build start
> 2019-Oct-07 17:48:25 :: [i586] #100 R-base.git 3.6.1-alt1: build start
> 2019-Oct-07 17:48:25 :: [aarch64] #100 R-base.git 3.6.1-alt1: build start
> 2019-Oct-07 17:48:25 :: [ppc64le] #100 R-base.git 3.6.1-alt1: build start
> make[3]: Leaving directory '/usr/src/RPM/BUILD/R-3.6.1/src/include/R_ext'
> make[4]: *** No rule to make target 'blas.f', needed by 'blas.o'.  Stop.
> make[3]: *** [Makefile:32: R] Error 2
> 2019-Oct-07 17:52:09 :: [i586] R-base.git 3.6.1-alt1: remote: build failed
> 2019-Oct-07 17:52:09 :: [i586] #100 R-base.git 3.6.1-alt1: build FAILED
> 2019-Oct-07 17:52:10 :: [i586] requesting cancellation of task processing
> 2019-Oct-07 18:01:40 :: [x86_64] #100 R-base.git 3.6.1-alt1: build OK
> 2019-Oct-07 18:07:42 :: [ppc64le] #100 R-base.git 3.6.1-alt1: build OK
> 2019-Oct-07 18:48:01 :: [aarch64] #100 R-base.git 3.6.1-alt1: build OK
> 2019-Oct-07 17:52:10 :: [i586] build FAILED
> 2019-Oct-07 18:48:01 :: task #238855 for sisyphus FAILED


-- 
KM

Re: [devel] [#238855] [test-only] FAILED R-base.git=3.6.1-alt1

[Kirill Maslinsky]

Denis Medvedev writes:

> почему в спеке R присутствует строка 38?

Затрудняюсь назвать точные причины, но могу указать на обстоятельства ее появления:

commit ebaab1deb41f3d162f62eb006cbeac6ba5af4b58
Author: Alexey Tourbin <at@altlinux.ru>
Date:   Mon Dec 11 00:52:53 2006 +0300

    spec: fix BLAS removal

diff --git a/R-base.spec b/R-base.spec
index 073b92f9..441dd653 100755
--- a/R-base.spec
+++ b/R-base.spec
@@ -31,7 +31,7 @@ called at run time.
 %prep
 %setup -q -n R-%version-%release
 rm src/extra/{zlib,bzip2,pcre}/*.[ch]
-rm src/appl/blas.f src/modules/lapack/*.f
+rm src/extra/blas/*.f src/modules/lapack/*.f

> возможно она дает такое?

Но почему она не дает такого на остальных архитектурах?

--
КМ

Re: [devel] [#238855] [test-only] FAILED R-base.git=3.6.1-alt1

[Vladislav Zavjalov]

On Mon, Oct 07, 2019 at 10:02:53PM +0300, Kirill Maslinsky wrote:
> 
> Всем привет,
> 
> Кто-нибудь может подсказать, что случилось с BLAS на архитектуре i586?
> Из-за этой ошибки уже несколько месяцев не пересобирается R, и,
> соответственно, не выложить новую версию. 

Кажется, разница в выводе configure начинается с
> checking whether double complex BLAS can be used... no

После этого он хочет компилировать свой blas.f (которые в спеке
специально удалили).

То есть, похоже, проблема в пакете openblas.

В openblas есть подозрительный коммит bb4bfedee23cadca76d91f31423cd05321cb333b
с чисткой спека. Возможно, надо там что-то потерянное найти.
Например, там потерялась STATIC_ALLOCATION=1 для i586, уж не знаю, оно
ли это. (А также потерялось BINARY64=1 для x86_64, которое явно используется в
Makefile).

Re: [devel] openblas (was: [#238855] [test-only] FAILED R-base.git=3.6.1-alt1)

[Dmitry V. Levin]

On Mon, Oct 07, 2019 at 11:49:50PM +0300, Vladislav Zavjalov wrote:
> On Mon, Oct 07, 2019 at 10:02:53PM +0300, Kirill Maslinsky wrote:
> > 
> > Всем привет,
> > 
> > Кто-нибудь может подсказать, что случилось с BLAS на архитектуре i586?
> > Из-за этой ошибки уже несколько месяцев не пересобирается R, и,
> > соответственно, не выложить новую версию. 
> 
> Кажется, разница в выводе configure начинается с
> > checking whether double complex BLAS can be used... no
> 
> После этого он хочет компилировать свой blas.f (которые в спеке
> специально удалили).
> 
> То есть, похоже, проблема в пакете openblas.
> 
> В openblas есть подозрительный коммит bb4bfedee23cadca76d91f31423cd05321cb333b
> с чисткой спека. Возможно, надо там что-то потерянное найти.
> Например, там потерялась STATIC_ALLOCATION=1 для i586, уж не знаю, оно
> ли это. (А также потерялось BINARY64=1 для x86_64, которое явно используется в
> Makefile).

Достаточно просто пересобрать пакет openblas, после чего R-base становится
собирающимся на i586, но начинает сегфолтиться в базовых тестах на x86_64.

Похоже, что в Сизифе не очень годный openblas.


-- 
ldv

Re: [devel] [#238855] [test-only] FAILED R-base.git=3.6.1-alt1

[Michael Shigorin]

On Mon, Oct 07, 2019 at 11:49:50PM +0300, Vladislav Zavjalov wrote:
> On Mon, Oct 07, 2019 at 10:02:53PM +0300, Kirill Maslinsky wrote:
> > Кто-нибудь может подсказать, что случилось с BLAS на архитектуре i586?
> > Из-за этой ошибки уже несколько месяцев не пересобирается R, и,
> > соответственно, не выложить новую версию. 
> 
> Кажется, разница в выводе configure начинается с
> > checking whether double complex BLAS can be used... no
> 
> После этого он хочет компилировать свой blas.f (которые в спеке
> специально удалили).
> 
> То есть, похоже, проблема в пакете openblas.
> 
> В openblas есть подозрительный коммит
> bb4bfedee23cadca76d91f31423cd05321cb333b с чисткой спека.
> Возможно, надо там что-то потерянное найти.  Например, там
> потерялась STATIC_ALLOCATION=1 для i586, уж не знаю, оно ли
> это. (А также потерялось BINARY64=1 для x86_64, которое явно
> используется в Makefile).

Опять всплыло: http://bugzilla.altlinux.org/45320

Кто-нибудь у нас действительно понимает в сборке openblas?

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin / http://altlinux.org
  ------ http://opennet.ru / http://anna-news.info