On Sat, 17 Jul 2010 16:06:04 +0700
Michael Pozhidaev wrote:

> >> Вопрос нормального обновления из основного репозитория (вопрос
> >> правильного выставления релиза) тоже пока остаётся.
> >
> > Через apt-preferences можно указать, что ваш дополнительный
> > репозиторий более приоритетен. В таком случае если пакет есть в
> > вашем репо, то он не должен будет выкачиваться из основного.
> > (Впрочем, не знаю точно что будет если в вашем репо пакет будет
> > иметь меньшую версию.)
> 
> Так это делать всем пользователям, кто поставил дистр с пропатченными
> пакетами?

Соберите свой apt-conf-foo например.

> Суть дела вот: я взял пакет foobar-x.y-alt1, сделал к нему
> патч и как-либо увеличил релиз. Например, поставил alt1.1.

Релизы для своего репозитория раздавать вида foo1.1 например. 
alt < foo поэтому релиз у вас всегда будет больший.