>  mono-1.2.6-alt3	Requires	/proc
> +mono-1.2.6-alt3	Requires	/usr/lib/libmono.so
>  mono-1.2.6-alt3	Requires	libX11.so.6

Файл mono.pc запакован сразу в два пакета -- mono и libmono-devel.
https://bugzilla.altlinux.org/show_bug.cgi?id=13863
Попробую побороть в ближайшее время.