>  ktoon-0.9-alt0.1	Provides	libstore.so.1
> +ktoon-0.9-alt0.1	Requires	/usr/lib/ktoon/plugins
>  ktoon-0.9-alt0.1	Requires	bash

В пакете есть ссылка
/usr/share/ktoon/plugins -> /usr/lib/ktoon/plugins
но каталог /usr/lib/ktoon/plugins не запакован.

То есть в spec-файле нужно добавить

+%dir %_libdir/%name/plugins
 %_libdir/%name/plugins/*.so

И, может быть, вообще не стоит делать ссылку
/usr/share/ktoon/plugins -> /usr/lib/ktoon/plugins