[Comm] libnetcdf7-seq

[Comm] libnetcdf7-seq

[adobrovolskii]

Hi,
Имеем такую картину:
The following packages have unmet dependencies:
  libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq
                  Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6
                  Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6
                  Depends: libcurl.so.4 (>= set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6)
E: Broken packages

на apt-repo
rpm ftp://ftp.linux.kiev.ua/pub/Linux/ALT/t6/branch i586 classic
rpm ftp://ftp.linux.kiev.ua/pub/Linux/ALT/t6/branch noarch classic

-- 
Regards,
Andrii Dobrovol`s`kyj

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[Andrii Dobrovol`s`kii]

-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE-----
Hash: SHA256

adobrovolskii пишет:
> Hi, Имеем такую картину: The following packages have unmet
> dependencies: libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq Depends:
> /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6 Depends:
> /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6 Depends: libcurl.so.4 (>=
> set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6) E: Broken packages
> 
> на apt-repo rpm ftp://ftp.linux.kiev.ua/pub/Linux/ALT/t6/branch
> i586 classic rpm
> ftp://ftp.linux.kiev.ua/pub/Linux/ALT/t6/branch noarch classic
> 
И в р6 та же картина. И просто так не развяжешь... 875 пакето в на
либу завязано...

- -- 
Rgrds,
Andriy
*********************************************************************
email: dobr at iop dot kiev dot ua            Kyiv, Ukraine
Phone: (380-44)   525-7824            Department of Gas Electronics
Fax:   (380-44)   525-2329             Institute of Physics of NASU
*********************************************************************
-----BEGIN PGP SIGNATURE-----
Version: GnuPG v1.4.10 (GNU/Linux)
Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/

iF4EAREIAAYFAk66tToACgkQpBPgR3404hM6KwEA4uyscm50gxVZgOQZJXq6Xmqn
dYgucn1OApBBUW0YArIBANKrYUYNbJCLZXG1WMytuVfKYOywkkcQO5AMSe+EoIhy
=7GqW
-----END PGP SIGNATURE-----

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[Andrii Dobrovol`s`kii]

-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE-----
Hash: SHA256

Andrii Dobrovol`s`kii пишет:
> adobrovolskii пишет:
>> Hi, Имеем такую картину: The following packages have unmet 
>> dependencies: libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq
>> Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6 Depends: 
>> /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6 Depends: libcurl.so.4
>> (>= set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6) E: Broken packages
> 
>> на apt-repo rpm
>> ftp://ftp.linux.kiev.ua/pub/Linux/ALT/t6/branch i586 classic
>> rpm ftp://ftp.linux.kiev.ua/pub/Linux/ALT/t6/branch noarch
>> classic
> 
> И в р6 та же картина. И просто так не развяжешь... 875 пакето в
> на либу завязано...
> 
install libnetcdf7-seq libcurl libnetcdf6-seq
libnetcdf6-seq is already the newest version.
Some packages could not be installed. This may mean that you have
requested an impossible situation or if you are using the unstable
distribution that some required packages have not yet been created
or been moved out of Incoming.
The following information may help to resolve the situation:

The following packages have unmet dependencies:
  libcurl: Depends: libssl.so.10 (>=
set:mgBO2HhUDmu80CWVMDGR7bVExf5UASZGfkayIVjyfqmVBskuGWEZGxA8ufd7lLB0tCmITXy86f32RVahSfmi2HPBlU6J1Zk8iNCO6R2RcH1d5ZLdwTb1)
  libnetcdf6-seq: Depends: libhdf5-6-seq
                  Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6
                  Depends: libhdf5.so.6
                  Depends: libhdf5_hl.so.6
  libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq
                  Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6
                  Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6
E: Broken packages

ИМХО, что-то сломано...
- -- 
Rgrds,
Andriy
*********************************************************************
email: dobr at iop dot kiev dot ua            Kyiv, Ukraine
Phone: (380-44)   525-7824            Department of Gas Electronics
Fax:   (380-44)   525-2329             Institute of Physics of NASU
*********************************************************************
-----BEGIN PGP SIGNATURE-----
Version: GnuPG v1.4.10 (GNU/Linux)
Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/

iF4EAREIAAYFAk66w0cACgkQpBPgR3404hPJwQD9Gv7qiTemRHEPWsF3gAiRfEOr
yZ9OzDY0yMxPm+KgrRcBALLINDUVtY91KvwGwC4Pui8WCqR2G2PwMj26VsB/cTnb
=Rrr2
-----END PGP SIGNATURE-----

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[REAL]

09.11.2011 22:03, adobrovolskii пишет:
> Имеем такую картину:
> The following packages have unmet dependencies:
>    libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq
>                    Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6
>                    Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6
>                    Depends: libcurl.so.4 (>= set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6)

Скопировал из сизифа, через сутки должно дойти до бранча.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[adobrovolskii]

2011/11/10 REAL <real@kemsu.ru>:
> 09.11.2011 22:03, adobrovolskii пишет:
>>
>> Имеем такую картину:
>> The following packages have unmet dependencies:
>>   libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq
>>                   Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6
>>                   Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6
>>                   Depends: libcurl.so.4 (>= set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6)
>
> Скопировал из сизифа, через сутки должно дойти до бранча.
>
Спасибо. Подожду...
-- 
Regards,
Andrii Dobrovol`s`kyj

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[adobrovolskii]

2011/11/10 adobrovolskii <adobrovolskii@gmail.com>:
> 2011/11/10 REAL <real@kemsu.ru>:
>> 09.11.2011 22:03, adobrovolskii пишет:
>>>
>>> Имеем такую картину:
>>> The following packages have unmet dependencies:
>>>   libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq
>>>                   Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6
>>>                   Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6
>>>                   Depends: libcurl.so.4 (>= set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6)
>>
>> Скопировал из сизифа, через сутки должно дойти до бранча.
>>
> Спасибо. Подожду...
Ничего не изменилось. Тотальное обновление обламывается с той же ошибкой.
В новых пакетах старая ошибка? Или новые пакеты ещё не появились?
-- 
Regards,
Andrii Dobrovol`s`kyj

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[REAL]

26.11.2011 17:33, adobrovolskii пишет:
>>>> The following packages have unmet dependencies:
>>>>    libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq
>>>>                    Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6
>>>>                    Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6
>>>>                    Depends: libcurl.so.4 (>= set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6)
>>>
> Ничего не изменилось. Тотальное обновление обламывается с той же ошибкой.
> В новых пакетах старая ошибка? Или новые пакеты ещё не появились?

только что на t6 сделал apt-get update, вот что получилось:

 > sudo apt-get install libnetcdf7-seq
Reading Package Lists... Done
Building Dependency Tree... Done
The following extra packages will be installed:
   libhdf5-7-seq
The following NEW packages will be installed:
   libhdf5-7-seq libnetcdf7-seq
0 upgraded, 2 newly installed, 0 removed and 42 not upgraded.
Need to get 1778kB of archives.
After unpacking 6165kB of additional disk space will be used.
Do you want to continue? [Y/n] y
Get:1 ftp://ftp.altlinux.org i586/classic libhdf5-7-seq 1.8.7-alt1 [986kB]
Get:2 ftp://ftp.altlinux.org i586/classic libnetcdf7-seq 4.1.3-alt1 
[792kB]
Fetched 1778kB in 4s (385kB/s)
Committing changes...
error: failed to stat /mnt/mmedia2: Value too large for defined data type
Preparing... 
################################################################# [100%]
1: libhdf5-7-seq 
################################################################# [ 50%]
2: libnetcdf7-seq 
################################################################# [100%]
Running /usr/lib/rpm/posttrans-filetriggers
Done.

так что проблема где-то на вашей стороне.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[adobrovolskii]

2011/11/27 REAL <real@kemsu.ru>:
> 26.11.2011 17:33, adobrovolskii пишет:
>>>>>
>>>>> The following packages have unmet dependencies:
>>>>>   libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq
>>>>>                   Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6
>>>>>                   Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6
>>>>>                   Depends: libcurl.so.4 (>=
>>>>> set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6)
>>>>
>> Ничего не изменилось. Тотальное обновление обламывается с той же ошибкой.
>> В новых пакетах старая ошибка? Или новые пакеты ещё не появились?
>
> только что на t6 сделал apt-get update, вот что получилось:
>
>> sudo apt-get install libnetcdf7-seq
> Reading Package Lists... Done
> Building Dependency Tree... Done
> The following extra packages will be installed:
>  libhdf5-7-seq
> The following NEW packages will be installed:
>  libhdf5-7-seq libnetcdf7-seq
> 0 upgraded, 2 newly installed, 0 removed and 42 not upgraded.
> Need to get 1778kB of archives.
> After unpacking 6165kB of additional disk space will be used.
> Do you want to continue? [Y/n] y
> Get:1 ftp://ftp.altlinux.org i586/classic libhdf5-7-seq 1.8.7-alt1 [986kB]
> Get:2 ftp://ftp.altlinux.org i586/classic libnetcdf7-seq 4.1.3-alt1 [792kB]
> Fetched 1778kB in 4s (385kB/s)
> Committing changes...
> error: failed to stat /mnt/mmedia2: Value too large for defined data type
> Preparing...
> ################################################################# [100%]
> 1: libhdf5-7-seq
> ################################################################# [ 50%]
> 2: libnetcdf7-seq
> ################################################################# [100%]
> Running /usr/lib/rpm/posttrans-filetriggers
> Done.
>
> так что проблема где-то на вашей стороне.
>
Я пробовал на р6. ОК. Попробую на t6

-- 
Regards,
Andrii Dobrovol`s`kyj

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[adobrovolskii]

On Mon, Nov 28, 2011 at 2:15 PM, adobrovolskii <adobrovolskii@gmail.com> wrote:
> 2011/11/27 REAL <real@kemsu.ru>:
>> 26.11.2011 17:33, adobrovolskii пишет:
>>>>>>
>>>>>> The following packages have unmet dependencies:
>>>>>>   libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-6-seq
>>>>>>                   Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.6
>>>>>>                   Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5_hl.so.6
>>>>>>                   Depends: libcurl.so.4 (>=
>>>>>> set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6)
>>>>>
>>> Ничего не изменилось. Тотальное обновление обламывается с той же ошибкой.
>>> В новых пакетах старая ошибка? Или новые пакеты ещё не появились?
>>
>> только что на t6 сделал apt-get update, вот что получилось:
>>
>>> sudo apt-get install libnetcdf7-seq
>> Reading Package Lists... Done
>> Building Dependency Tree... Done
>> The following extra packages will be installed:
>>  libhdf5-7-seq
>> The following NEW packages will be installed:
>>  libhdf5-7-seq libnetcdf7-seq
>> 0 upgraded, 2 newly installed, 0 removed and 42 not upgraded.
>> Need to get 1778kB of archives.
>> After unpacking 6165kB of additional disk space will be used.
>> Do you want to continue? [Y/n] y
>> Get:1 ftp://ftp.altlinux.org i586/classic libhdf5-7-seq 1.8.7-alt1 [986kB]
>> Get:2 ftp://ftp.altlinux.org i586/classic libnetcdf7-seq 4.1.3-alt1 [792kB]
>> Fetched 1778kB in 4s (385kB/s)
>> Committing changes...
>> error: failed to stat /mnt/mmedia2: Value too large for defined data type
>> Preparing...
>> ################################################################# [100%]
>> 1: libhdf5-7-seq
>> ################################################################# [ 50%]
>> 2: libnetcdf7-seq
>> ################################################################# [100%]
>> Running /usr/lib/rpm/posttrans-filetriggers
>> Done.
>>
>> так что проблема где-то на вашей стороне.
>>> --
> Regards,
> Andrii Dobrovol> --
> Regards,
> Andrii Dobrovol`s`kyj
>


`s`kyj
>



> Я пробовал на р6. ОК. Попробую на t6
>
Я пытаюсь сделать апгрейд с 5.1 до шестого. И он не проходит
оламывается из-за libnetcdf7-seq. Оно не устанавливаетя из-за
конфликта по файлам с libnetcdf6-seq. А то, что оно устанавливается с
нуля -- не показатель.
Или скажите где может локально что-то сломаться чтоб рпм видел
файловый конфликт?
-- 
Regards,
Andrii Dobrovol`s`kyj

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[REAL]

01.12.2011 04:38, adobrovolskii пишет:
> Я пытаюсь сделать апгрейд с 5.1 до шестого. И он не проходит
> оламывается из-за libnetcdf7-seq. Оно не устанавливаетя из-за
> конфликта по файлам с libnetcdf6-seq.

А Вы попробуйте вот так:
 > sudo apt-get install libnetcdf7-seq libnetcdf6-seq-

Если вынесутся какие-то пакеты при этом, поставьте их обратно. Я с 5.1 
дел никаких не имел, поэтому за апгрейд оттуда до куда-то ещё не 
отвечаю ;)

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[adobrovolskii]

On Thu, Dec 1, 2011 at 5:14 AM, REAL <real@kemsu.ru> wrote:
> 01.12.2011 04:38, adobrovolskii пишет:
>>
>> Я пытаюсь сделать апгрейд с 5.1 до шестого. И он не проходит
>> оламывается из-за libnetcdf7-seq. Оно не устанавливаетя из-за
>> конфликта по файлам с libnetcdf6-seq.
>
> А Вы попробуйте вот так:
>> sudo apt-get install libnetcdf7-seq libnetcdf6-seq-
>
> Если вынесутся какие-то пакеты при этом, поставьте их обратно. Я с 5.1 дел
> никаких не имел, поэтому за апгрейд оттуда до куда-то ещё не отвечаю ;)
>
Если так пытаться сделать, будет вынесено пол системы.
Проверено. Тут вопрос не в 5.1 а в том, что у пакетов libnetcdf7-seq и
libnetcdf6-seq из 5.1 имеется файловый конфликт мешающий нормальному
обновлению. И его надо разрешить. Для нормального обновления с
прошлого бранча до текущего.
-- 
Regards,
Andrii Dobrovol`s`kyj

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[Michael Shigorin]

On Thu, Dec 01, 2011 at 09:14:53AM +0600, REAL wrote:
> >из-за libnetcdf7-seq. Оно не устанавливаетя из-за конфликта по
> >файлам с libnetcdf6-seq.
> Я с 5.1 дел никаких не имел, поэтому за апгрейд оттуда до
> куда-то ещё не отвечаю ;)

Тем не более можешь глянуть в отчёты репокопа, он и про
необъявленные (путём Conflicts:) файловые конфликты говорит.

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[REAL]

01.12.2011 17:23, adobrovolskii пишет:
>> А Вы попробуйте вот так:
>>> sudo apt-get install libnetcdf7-seq libnetcdf6-seq-
>>
>> Если вынесутся какие-то пакеты при этом, поставьте их обратно. Я с 5.1 дел
>> никаких не имел, поэтому за апгрейд оттуда до куда-то ещё не отвечаю ;)
>>
> Если так пытаться сделать, будет вынесено пол системы.
> Проверено.

Не верю. От netcdf/libhdf5 зависит очень мало пакетов. Вынести 
пол-системы при таком раскладе никак не возможно.

> Тут вопрос не в 5.1 а в том, что у пакетов libnetcdf7-seq и
> libnetcdf6-seq из 5.1 имеется файловый конфликт мешающий нормальному
> обновлению. И его надо разрешить. Для нормального обновления с
> прошлого бранча до текущего.

Выслушаю предложения.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[REAL]

01.12.2011 19:49, Michael Shigorin пишет:
> On Thu, Dec 01, 2011 at 09:14:53AM +0600, REAL wrote:
>>> из-за libnetcdf7-seq. Оно не устанавливаетя из-за конфликта по
>>> файлам с libnetcdf6-seq.
>> Я с 5.1 дел никаких не имел, поэтому за апгрейд оттуда до
>> куда-то ещё не отвечаю ;)
>
> Тем не более можешь глянуть в отчёты репокопа, он и про
> необъявленные (путём Conflicts:) файловые конфликты говорит.

Репокоп отчитывается только по Сизифу, а там таких конфликтов, само 
собой, нет.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[Michael Shigorin]

On Fri, Dec 02, 2011 at 03:31:49PM +0200, Andrii Dobrovol`s`kii wrote:
> Да. Именно эта команда не выносит пол системы. Она вообще не проходит.

Кстати -- у тебя на холдах случайно ничего зависимого от не?

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[Michael Shigorin]

On Fri, Dec 02, 2011 at 03:31:49PM +0200, Andrii Dobrovol`s`kii wrote:
> >> Тут вопрос не в 5.1 а в том, что у пакетов libnetcdf7-seq и 
> >> libnetcdf6-seq из 5.1 имеется файловый конфликт мешающий
> >> нормальному обновлению. И его надо разрешить. Для нормального
> >> обновления с прошлого бранча до текущего.
> > Выслушаю предложения.
> Избавиться от файловых конфликтов. Какие ещё могут быть предложения?
> Просто взять и починить пакет...

Прелестно.  Только вот скорее придётся прописать
в спеке, из которого собирается libnetcdf7-seq,
Conflicts: libnetcdf6-seq

> file /usr/lib/hdf5-seq/bin/ncdump from install of
> libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
> libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[adobrovolskii]

On Fri, Dec 2, 2011 at 2:33 PM, Michael Shigorin <mike@osdn.org.ua> wrote:
> On Fri, Dec 02, 2011 at 03:31:49PM +0200, Andrii Dobrovol`s`kii wrote:
>> Да. Именно эта команда не выносит пол системы. Она вообще не проходит.
>
> Кстати -- у тебя на холдах случайно ничего зависимого от не?
>
cat /etc/apt/apt.conf
/*
 * This is the main configuration file for the APT suite of tools,
 * see apt.conf(5) for details.
 */

// See apt-cdrom(8) for details.
Acquire::CDROM::Copy "true";
Acquire::CDROM::mount "/media/cdrom";

Acquire::http::Pipeline-Depth <<0>>;
Acquire::ftp::Pipeline-Depth <<0>>;

Acquire::http::No-Cache "true";
Acquire::http::Max-Age "3600";

APT::Cache-Limit "50000000";

RPM
{
	Allow-Duplicated {
		// Old-style kernels.
		"^(NVIDIA_)?(kernel|alsa)[0-9]*(-adv|-linus)?($|-up|-smp|-secure|-custom|-enterprise|-BOOT|-tape|-aureal)";
		// New-style kernels.
		"^kernel-(image|modules)-.*";
	};
	Hold {
		// Old-style kernels.
		"^(kernel|alsa)[0-9]+-source";
	};
};

Ещё где-то может быть?
-- 
Regards,
Andrii Dobrovol`s`kyj

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[adobrovolskii]

On Fri, Dec 2, 2011 at 2:35 PM, Michael Shigorin <mike@osdn.org.ua> wrote:
> On Fri, Dec 02, 2011 at 03:31:49PM +0200, Andrii Dobrovol`s`kii wrote:
>> >> Тут вопрос не в 5.1 а в том, что у пакетов libnetcdf7-seq и
>> >> libnetcdf6-seq из 5.1 имеется файловый конфликт мешающий
>> >> нормальному обновлению. И его надо разрешить. Для нормального
>> >> обновления с прошлого бранча до текущего.
>> > Выслушаю предложения.
>> Избавиться от файловых конфликтов. Какие ещё могут быть предложения?
>> Просто взять и починить пакет...
>
> Прелестно.  Только вот скорее придётся прописать
> в спеке, из которого собирается libnetcdf7-seq,
> Conflicts: libnetcdf6-seq
>
>> file /usr/lib/hdf5-seq/bin/ncdump from install of
>> libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
>> libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
>
И это как-то починит dist-upgrade?
-- 
Regards,
Andrii Dobrovol`s`kyj

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[Andrii Dobrovol`s`kii]

-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE-----
Hash: SHA256

REAL пишет:
> 01.12.2011 17:23, adobrovolskii пишет:
>>> А Вы попробуйте вот так:
>>>> sudo apt-get install libnetcdf7-seq libnetcdf6-seq-
>>> 
>>> Если вынесутся какие-то пакеты при этом, поставьте их
>>> обратно. Я с 5.1 дел никаких не имел, поэтому за апгрейд
>>> оттуда до куда-то ещё не отвечаю ;)
>>> 
>> Если так пытаться сделать, будет вынесено пол системы. 
>> Проверено.
> 
> Не верю. От netcdf/libhdf5 зависит очень мало пакетов. Вынести 
> пол-системы при таком раскладе никак не возможно.
> 
sudo apt-get install libnetcdf7-seq libnetcdf6-seq-
[sudo] password for andriy:
Reading Package Lists... Done
Building Dependency Tree... Done
Some packages could not be installed. This may mean that you have
requested an impossible situation or if you are using the unstable
distribution that some required packages have not yet been created
or been moved out of Incoming.
The following information may help to resolve the situation:

The following packages have unmet dependencies:
  libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-7-seq
                  Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.7
                  Depends: libcurl.so.4 (>=
set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6)
                  Depends: libhdf5.so.7 (>=
set:phjjs8byKthF1Av0FOwrdaIbFj09cMTlr09YkK5aIZG0ktFwDJ0ldPC40plPuwvtuQAZHLNI21isuFXRTR2DhZmrvtiayVICw8eihokbBYvmdM64188qofsQdZlA4N2GXpISOQuSfzEjcHBzamRZyDU0ZH9ZoNXHjZq1wTG3B1oZK9fv2DL1zVNoUGwokgW24L8AUVd6Wa9hoPb1k7Su0Z4q5aVNFXSzZaKaVLlYJEMvHJiZL1lohWCG4NYI0i14jnfFjgyy1hn7sCJ3tX9g0QdsqIGZDbIoyftGasnTpPRhXAEHWSWO0nPAW4JVjgRUU7Uaf4Ykz9GH71ImV7yMQ08zTWikJ6UZoXzBdR0Sscpq80KU528rxmcFZ99N67gjvF4G)
                  Depends: libhdf5_hl.so.7 (>=
set:li1Z47DGMLibgZFLajgSwh)
E: Broken packages

Да. Именно эта команда не выносит пол системы. Она вообще не проходит.

rpm -qa|grep netcdf
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1

>> Тут вопрос не в 5.1 а в том, что у пакетов libnetcdf7-seq и 
>> libnetcdf6-seq из 5.1 имеется файловый конфликт мешающий
>> нормальному обновлению. И его надо разрешить. Для нормального
>> обновления с прошлого бранча до текущего.
> 
> Выслушаю предложения.
> 
Избавиться от файловых конфликтов. Какие ещё могут быть предложения?
Просто взять и починить пакет...

file /usr/lib/hdf5-seq/bin/ncdump from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/lib/hdf5-seq/bin/ncgen from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/share/info/netcdf-c.info-1.bz2 from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/share/info/netcdf-c.info-2.bz2 from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/share/info/netcdf-cxx.info.bz2 from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/share/info/netcdf-f77.info-1.bz2 from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/share/info/netcdf-f77.info-2.gz from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/share/info/netcdf-f90.info.bz2 from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/share/info/netcdf-install.info.bz2 from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/share/info/netcdf-tutorial.info.bz2 from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
file /usr/share/info/netcdf.info.bz2 from install of
libnetcdf7-seq-4.1.3-alt1 conflicts with file from package
libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1
Reading Package Lists... Done

Какая ещё информация нужна?
- -- 
Rgrds,
Andriy
*********************************************************************
email: dobr at iop dot kiev dot ua            Kyiv, Ukraine
Phone: (380-44)   525-7824            Department of Gas Electronics
Fax:   (380-44)   525-2329             Institute of Physics of NASU
*********************************************************************
-----BEGIN PGP SIGNATURE-----
Version: GnuPG v1.4.10 (GNU/Linux)
Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/

iF4EAREIAAYFAk7Y0z4ACgkQpBPgR3404hNiFwEA4/VARZPJTDzq0n4C5mnGHcKk
PZy3qZOcnyjgPZsvk+QA/R8h7BdqJMXyy8TPp8weRpBr/d/4iASMfAKLEyLtnk3p
=kGy4
-----END PGP SIGNATURE-----

Re: [Comm] libnetcdf7-seq

[REAL]

02.12.2011 19:31, Andrii Dobrovol`s`kii пишет:
>> Не верю. От netcdf/libhdf5 зависит очень мало пакетов. Вынести
>> пол-системы при таком раскладе никак не возможно.
>>
> sudo apt-get install libnetcdf7-seq libnetcdf6-seq-
> [sudo] password for andriy:
> Reading Package Lists... Done
> Building Dependency Tree... Done
> Some packages could not be installed. This may mean that you have
> requested an impossible situation or if you are using the unstable
> distribution that some required packages have not yet been created
> or been moved out of Incoming.
> The following information may help to resolve the situation:
>
> The following packages have unmet dependencies:
>    libnetcdf7-seq: Depends: libhdf5-7-seq
>                    Depends: /usr/lib/hdf5-seq/lib/libhdf5.so.7
>                    Depends: libcurl.so.4 (>=
> set:mjDxT7U3mWcfpNcVWdUM5n6)
>                    Depends: libhdf5.so.7 (>=
> set:phjjs8byKthF1Av0FOwrdaIbFj09cMTlr09YkK5aIZG0ktFwDJ0ldPC40plPuwvtuQAZHLNI21isuFXRTR2DhZmrvtiayVICw8eihokbBYvmdM64188qofsQdZlA4N2GXpISOQuSfzEjcHBzamRZyDU0ZH9ZoNXHjZq1wTG3B1oZK9fv2DL1zVNoUGwokgW24L8AUVd6Wa9hoPb1k7Su0Z4q5aVNFXSzZaKaVLlYJEMvHJiZL1lohWCG4NYI0i14jnfFjgyy1hn7sCJ3tX9g0QdsqIGZDbIoyftGasnTpPRhXAEHWSWO0nPAW4JVjgRUU7Uaf4Ykz9GH71ImV7yMQ08zTWikJ6UZoXzBdR0Sscpq80KU528rxmcFZ99N67gjvF4G)
>                    Depends: libhdf5_hl.so.7 (>=
> set:li1Z47DGMLibgZFLajgSwh)
> E: Broken packages

это на t6 такое?

> rpm -qa|grep netcdf
> libnetcdf6-seq-4.0.1-alt4.1

просто надо удалить его, а потом поставить то, что оно за собой вынесет.

>> Выслушаю предложения.
>>
> Избавиться от файловых конфликтов. Какие ещё могут быть предложения?
> Просто взять и починить пакет...

намного проще у себя на месте удалить пакет, которого не только в 
сизифе, но и в бранче-то нет. я открыто заявлял, что бранч 
поддерживать буду только один: t6. какие там проблемы у тех, кто 
вовремя не обновился до сизифа перед бранчеванием, что я здесь 
неоднократно настойчиво советовал сделать, меня не интересует. я не 
хочу тратить время на решение проблем тех, кто не прислушивается к 
советам.

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ