[Comm] DICOM

[Comm] DICOM

[anyr]

Ищу софтину для просмотра dicom (формат медицинских изображений). Не какую-
нибудь специфичную, для конкретной области, а в целом, вроде efilm.

Перебрал не очень много, но уже достаточно, чтобы устать. Те, что на java 
почти не пробовал, только imagej.

Собрал пакет и использую, насколько это возможно xmedcon 
(http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/xmedcon). Эта программа показывает 
изображения, но не умеет открывать dicomdir (по крайней мере мне не 
удалось), не умеет проигрывать серию, как ролик и для получения 
дополнительной информации хранящейся в снимках надо совершить слишком много 
телодвижений.

Также для решения будущих зависимостей успел собрать dcmtk 
(http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/dcmtk), но так и не собрал 
работающие на нем приложения. В частности пробовал aeskulap. Он в своем 
нутре несет копию dcmtk, выдрать которую так, чтобы не обвалилась сборка, 
мне так и не удалось.

Если кто-нибудь направит энергию в нужное русло, буду очень признателен.

P.S.: Пробовал запустить вьювер, который идет на дисках от GE, но он требует 
ie+activex, а ieinstall у нас не нынче не работает :( 
https://bugzilla.altlinux.org/show_bug.cgi?id=20958
-- 
Andrey Yurkovsky

Re: [Comm] DICOM

[Slava Dubrovskiy]

[-- Attachment #1: Type: text/plain, Size: 2582 bytes --]

12.01.2010 21:13, anyr@tut.by пишет:
> Ищу софтину для просмотра dicom (формат медицинских изображений). Не какую-
> нибудь специфичную, для конкретной области, а в целом, вроде efilm.
>
>   
Ну в целом ImageMagick умеет вроде.
> Перебрал не очень много, но уже достаточно, чтобы устать. Те, что на java 
> почти не пробовал, только imagej.
>
> Собрал пакет и использую, насколько это возможно xmedcon 
> (http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/xmedcon). Эта программа показывает 
> изображения, но не умеет открывать dicomdir (по крайней мере мне не 
> удалось), не умеет проигрывать серию, как ролик и для получения 
> дополнительной информации хранящейся в снимках надо совершить слишком много 
> телодвижений.
>
> Также для решения будущих зависимостей успел собрать dcmtk 
> (http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/dcmtk), но так и не собрал 
> работающие на нем приложения. В частности пробовал aeskulap. Он в своем 
> нутре несет копию dcmtk, выдрать которую так, чтобы не обвалилась сборка, 
> мне так и не удалось.
>   
Ну и пусть несет, мало что-ли таких программ?
> Если кто-нибудь направит энергию в нужное русло, буду очень признателен.
>   
Вообщем-то могу помочь если что, т.к. есть где и что смотреть.
Хороший сайт с большим к-вом разнообразных программ http://www.nitrc.org/
Может там что-то найдете.

Я когда-то использовал один вьювер, но он был под винду.

> P.S.: Пробовал запустить вьювер, который идет на дисках от GE, но он требует 
> ie+activex, а ieinstall у нас не нынче не работает :( 
> https://bugzilla.altlinux.org/show_bug.cgi?id=20958
>   
Есть такое.

-- 

WBR,
Dubrovskiy Vyacheslav


[-- Attachment #2: S/MIME Cryptographic Signature --]
[-- Type: application/pkcs7-signature, Size: 3262 bytes --]

Re: [Comm] DICOM

[anyr]

Slava Dubrovskiy wrote:

> 12.01.2010 21:13, anyr@tut.by пишет:
>> Ищу софтину для просмотра dicom (формат медицинских изображений). Не
>> какую- нибудь специфичную, для конкретной области, а в целом, вроде
>> efilm.
>>
>>   
> Ну в целом ImageMagick умеет вроде.
В целом и xmedcon смотрит, даже показывает дополнительную информацию, но не 
удобно.
>> Перебрал не очень много, но уже достаточно, чтобы устать. Те, что на java
>> почти не пробовал, только imagej.
>>
>> Собрал пакет и использую, насколько это возможно xmedcon
>> (http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/xmedcon). Эта программа
>> показывает изображения, но не умеет открывать dicomdir (по крайней мере
>> мне не удалось), не умеет проигрывать серию, как ролик и для получения
>> дополнительной информации хранящейся в снимках надо совершить слишком
>> много телодвижений.
>>
>> Также для решения будущих зависимостей успел собрать dcmtk
>> (http://www.sisyphus.ru/ru/srpm/Sisyphus/dcmtk), но так и не собрал
>> работающие на нем приложения. В частности пробовал aeskulap. Он в своем
>> нутре несет копию dcmtk, выдрать которую так, чтобы не обвалилась сборка,
>> мне так и не удалось.
>>   
> Ну и пусть несет, мало что-ли таких программ?
>> Если кто-нибудь направит энергию в нужное русло, буду очень признателен.
>>   
> Вообщем-то могу помочь если что, т.к. есть где и что смотреть.
Спасибо. Не упущу возможности ;) Попробую снова, но уже только через 
несколько дней.
> Хороший сайт с большим к-вом разнообразных программ http://www.nitrc.org/
> Может там что-то найдете.
Я выбирал на http://www.idoimaging.com/ На нем есть для разных платформ.
> Я когда-то использовал один вьювер, но он был под винду.
> 
>> P.S.: Пробовал запустить вьювер, который идет на дисках от GE, но он
>> требует ie+activex, а ieinstall у нас не нынче не работает :(
>> https://bugzilla.altlinux.org/show_bug.cgi?id=20958
>>   
> Есть такое.
> 

-- 
Andrey Yurkovsky

Re: [Comm] DICOM

[slava]

>> Хороший сайт с большим к-вом разнообразных программ
>> http://www.nitrc.org/
>> Может там что-то найдете.
> Я выбирал на http://www.idoimaging.com/ На нем есть для разных платформ.
>> Я когда-то использовал один вьювер, но он был под винду.
Вот это юзали
http://en.bio-soft.net/draw/OSIRIS.html

Я думаю под wine пойдет точно.

Ну и еще список с того сайта
http://en.bio-soft.net/draw.html

--
WBR
Slava

Re: [Comm] DICOM

[anyr]

Slava Dubrovskiy wrote:

> Вообщем-то могу помочь если что, т.к. есть где и что смотреть.
Потестируйте пожалуйста aeskulap.

У меня он показывает список пациентов с диска (dciomdir), но не открывает 
изображения. Если отдельно открыть изображения, то он их показывает.

Нет никаких фильтров, что неудобно.
-- 
Andrey Yurkovsky

Re: [Comm] DICOM

[Slava Dubrovskiy]

[-- Attachment #1: Type: text/plain, Size: 2664 bytes --]

09.02.2010 19:42, anyr@tut.by пишет:
> Slava Dubrovskiy wrote:
>
>   
>> Вообщем-то могу помочь если что, т.к. есть где и что смотреть.
>>     
> Потестируйте пожалуйста aeskulap.
>
> У меня он показывает список пациентов с диска (dciomdir), но не открывает 
> изображения. Если отдельно открыть изображения, то он их показывает.
>
> Нет никаких фильтров, что неудобно.
>   
Да, тоже не работает. Вот в консоли что.

StudyManager::load_dicomdir(/media/VOLUME1/dicomdir)
turning cursor busy
Reading DICOMDIR from [/media/VOLUME1/dicomdir]
WARNING: Bad DICOMDIR SubRecord type[18] for Study found
WARNING: Bad DICOMDIR SubRecord type[16] for Study found
cursor busy off

Тут кликнул открыть исследование.


StudyManager::on_test_study_expand()
turning cursor busy
WARNING: study[] not found in DICOMDIR
StudyManager::on_filter_search()
turning cursor busy
NEW QUERY:

# Dicom-Data-Set
# Used TransferSyntax: UnknownTransferSyntax
(0008,0005) CS [ISO_IR 100]                             #  10, 1
SpecificCharacterSet
(0008,0020) DA (no value available)                     #   0, 0 StudyDate
(0008,0030) TM (no value available)                     #   0, 0 StudyTime
(0008,0050) SH (no value available)                     #   0, 0
AccessionNumber
(0008,0052) CS [STUDY]                                  #   6, 1
QueryRetrieveLevel
(0008,0061) CS (no value available)                     #   0, 0
ModalitiesInStudy
(0008,0062) UI (no value available)                     #   0, 0
SOPClassesInStudy
(0008,1030) LO (no value available)                     #   0, 0
StudyDescription
(0010,0010) PN [*]                                      #   2, 1
PatientsName
(0010,0020) LO (no value available)                     #   0, 0 PatientID
(0010,0030) DA (no value available)                     #   0, 0
PatientsBirthDate
(0010,0040) CS (no value available)                     #   0, 0 PatientsSex
(0020,000d) UI (no value available)                     #   0, 0
StudyInstanceUID
(0020,0010) SH (no value available)                     #   0, 0 StudyID
(0020,1206) IS (no value available)                     #   0, 0
NumberOfStudyRelatedSeries
(0020,1208) IS (no value available)                     #   0, 0
NumberOfStudyRelatedInstances
QueryServerGroup()
cursor busy off
no results !!!


Странно. Отдельно изображения открывает.


-- 
WBR,
Dubrovskiy Vyacheslav


[-- Attachment #2: S/MIME Cryptographic Signature --]
[-- Type: application/pkcs7-signature, Size: 3262 bytes --]

Re: [Comm] DICOM

[anyr]

Slava Dubrovskiy wrote:

> Странно. Отдельно изображения открывает.
Не знаю, это проблема моей сборки, или проблема самой софтины.
Может есть возможность проверить адекватность поведения на debian 
(http://packages.debian.org/ru/lenny/aeskulap) ?

Ошибок при сборке вроде не было, но если я накосячил, придется более 
внимательно пересматривать логи.
-- 
Andrey Yurkovsky

Re: [Comm] DICOM

[anyr]

anyr@tut.by wrote:

> В частности пробовал aeskulap. Он в своем
> нутре несет копию dcmtk, выдрать которую так, чтобы не обвалилась сборка,
> мне так и не удалось.
Собрать aeskulap c оторванным dcmtk все таки получилось.

Отправил на сборку, скоро должен появиться на 
http://www.sisyphus.ru/ru/packager/anyr/srpms
для сизифа и 5.1
-- 
Andrey Yurkovsky