Re: [Comm] сборка Olex2

Re: [Comm] сборка Olex2

[Pavel Solntsev]

Сборка Olex2 откладывается до появления в сизифе cctbx (REAL уже
работает, я надеюсь).
Скинте мне, если можно, ссылку на svn версию.

Re: [Comm] сборка Olex2

[REAL]

Pavel Solntsev пишет:
> Сборка Olex2 откладывается до появления в сизифе cctbx (REAL уже
> работает, я надеюсь).

Да, сейчас заканчиваю безгуёвую версию ccp4 (в составе которого cctbx 
phaser), тут были некоторые проблемы, с одной стороны, загруз на 
сервере, с другой, на gui много времени потратил, пока не решил, что 
это потом. Всё упирается именно в это. Ну и в низкую скорость сборки 
(по часу на попытку). А сборка уже самого cctbx вряд ли много крови 
выпьет ;)

 > Скинте мне, если можно, ссылку на svn версию.

svn co https://cctbx.svn.sourceforge.net/svnroot/cctbx cctbx

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [Comm] сборка Olex2

[Pavel Solntsev]

REAL пишет:
> Pavel Solntsev пишет:
>> Сборка Olex2 откладывается до появления в сизифе cctbx (REAL уже
>> работает, я надеюсь).
>
> Да, сейчас заканчиваю безгуёвую версию ccp4 (в составе которого cctbx
> phaser), тут были некоторые проблемы, с одной стороны, загруз на
> сервере, с другой, на gui много времени потратил, пока не решил, что
> это потом. Всё упирается именно в это. Ну и в низкую скорость сборки
> (по часу на попытку). А сборка уже самого cctbx вряд ли много крови
> выпьет ;)
>
:)
> > Скинте мне, если можно, ссылку на svn версию.
>
> svn co https://cctbx.svn.sourceforge.net/svnroot/cctbx cctbx
>
Я про Olex2

Re: [Comm] сборка Olex2

[Denis G. Samsonenko]

Привет!

25 февраля 2009 г. 13:48 Pavel Solntsev написал:
>> > Скинте мне, если можно, ссылку на svn версию.
>>
>> svn co https://cctbx.svn.sourceforge.net/svnroot/cctbx cctbx
>>
> Я про Olex2

svn co https://olex2.svn.sourceforge.net/svnroot/olex2 olex2

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [Comm] сборка Olex2

[Pavel Solntsev]

Denis G. Samsonenko пишет:
> Привет!
>
> 25 февраля 2009 г. 13:48 Pavel Solntsev написал:
>   
>>>> Скинте мне, если можно, ссылку на svn версию.
>>>>         
>>> svn co https://cctbx.svn.sourceforge.net/svnroot/cctbx cctbx
>>>
>>>       
>> Я про Olex2
>>     
>
> svn co https://olex2.svn.sourceforge.net/svnroot/olex2 olex2
>
>   
Спасибо, я уже догадался, вчера не смог стянуть, думал squid хулиганит
наш :)

Re: [Comm] сборка Olex2

[REAL]

Pavel Solntsev пишет:
>>> Скинте мне, если можно, ссылку на svn версию.
>>
> Я про Olex2

svn co https://olex2.svn.sourceforge.net/svnroot/olex2 olex2

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ

Re: [Comm] сборка Olex2

[Pavel Solntsev]

Denis G. Samsonenko пишет:
> День добрый!
>
> Павел, как у вас обстоят дела со сборкой Olex2? 
Olex2 собрал. Но, господа, он настолько глючный. Надо еще допиливать и
допиливать.
То что я увидел меня не то что не удивило, а даже разочаровало. Как
альтернатива  рекомендую
 CRYSTALS (http://www.xtl.ox.ac.uk/crystals.html).  Мне один дядя,
который у Уоткина стажировался,
говорил, что многие модули из него были позаимствованы Шелдриком. Кстати
возможности
программы для небольших молекул существенно превосходят shelx.
При сборке Crystals другая проблема. Она хочет старую версию gcc и wxGTK.
Если руки дойдут - буду пробовать решить эту проблему.
> Я попробовал собрать
> скачанные сегодня с svn исходники с вашим Makefile на бранче-4.1, но
> похоже неудачно. Прикрепляю лог к данному письму. Если у вас
> получается собрать его, то не могли бы вы сказать, в чём у меня
> загвоздка, или может вы можете выслать мне собранный вариант?
>
>   

Re: [Comm] сборка Olex2

[REAL]

Привет!

Pavel Solntsev пишет:
> Olex2 собрал. Но, господа, он настолько глючный. Надо еще допиливать и
> допиливать.

Кстати, CCP4 (минимальный набор) тоже собрал. С ним ещё работать и 
работать, в смысле опакечивания компонент, включая gui. cctbx немного 
задерживается, ибо в процессе попыток установить (сборка в хэшере уже 
проходит, правда, около часа требуется, если тесты отключить) 
оказалось, что ему нужны отсутствующие в сизифе модули (в частности 
PyMol и Pyfort, которыми как раз с сегодняшнего дня собираюсь заняться).

В общем, я предполагал, что тема это довольно масштабная, но не сразу 
сообразил, что тут дело идёт о целом программном комплексе с кучей 
всего, к тому же на питон и фортран одновременно завязанное ;)

> То что я увидел меня не то что не удивило, а даже разочаровало. Как
> альтернатива  рекомендую
>  CRYSTALS (http://www.xtl.ox.ac.uk/crystals.html).  Мне один дядя,
[...]
> При сборке Crystals другая проблема. Она хочет старую версию gcc и wxGTK.
> Если руки дойдут - буду пробовать решить эту проблему.

Интересно. Возьму на заметку, так, на всякий случай...

-- 

REAL aka Евгений Ростовцев, программист ЦНИТ КемГУ