[Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Michael Shigorin]

	Здравствуйте.
Кто-то спрашивал, а тут случайно подвернулось:

--- http://rus-linux.net/
MarvinSketch Из пакета Marvin Beans от ChemAxon. На яве. Для
скачивания требуется регистрация.
Это, пожалуй, лучшая из бесплатных рисовалка химических формул
для linux (и не только). По удобству и возможностям вполне
сопоставима с ChemDraw. Особо стоит отметить возможность перевода
нарисованных двумерных структур в трехмерные (благодаря
встроенной молекулярной механике). Реализована (пока только в
нестабильной версии) OLE-интеграция с OpenOffice.
В комплект Marvin Beans также входят:
MarvinView - вьювер двух- и трехмерных химических структур,
MarvinSpace - программа для 3D-визуализации молекул и
MolConverter - конвертер химических форматов, аналог OpenBabel.
--- http://www.chemaxon.com/product/msketch.html

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Aleksander N.Gorohovski]

On Sat, 21 Apr 2007 20:01:01 +0400, Michael Shigorin wrote:

> 	Здравствуйте.
> Кто-то спрашивал, а тут случайно подвернулось:

Миша,
Премного благодарен!
:)

Классная программа. Гораздо удобнее ChemDraw.
И на удивление установилась очень легко (ALT Master2.4)
без лишних телодвижений всё работает.

> --- http://rus-linux.net/
> MarvinSketch Из пакета Marvin Beans от ChemAxon. На яве. Для
> скачивания требуется регистрация.
> Это, пожалуй, лучшая из бесплатных рисовалка химических формул
> для linux (и не только). По удобству и возможностям вполне
> сопоставима с ChemDraw. Особо стоит отметить возможность перевода
> нарисованных двумерных структур в трехмерные (благодаря
> встроенной молекулярной механике). Реализована (пока только в
> нестабильной версии) OLE-интеграция с OpenOffice.
> В комплект Marvin Beans также входят:
> MarvinView - вьювер двух- и трехмерных химических структур,
> MarvinSpace - программа для 3D-визуализации молекул и
> MolConverter - конвертер химических форматов, аналог OpenBabel.
> --- http://www.chemaxon.com/product/msketch.html

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[smont]

>       Здравствуйте.
> Кто-то спрашивал, а тут случайно подвернулось:

Для коллекции -- ешё одна химическая рисовалка.
http://www-drfmc.cea.fr/sp2m/L_Sim/V_Sim/index.en.html
Удачи!

-- 
С уважением,
 smont                          mailto:smont@mail.ru

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Michael Shigorin]

On Sat, Apr 21, 2007 at 09:04:49PM +0400, Aleksander N.Gorohovski wrote:
> >Кто-то спрашивал, а тут случайно подвернулось:
> Премного благодарен!
> :)

YW :)

> Классная программа. Гораздо удобнее ChemDraw.
> И на удивление установилась очень легко (ALT Master2.4)
> без лишних телодвижений всё работает.

А опакетить не хочется?

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Dmytro Kovalskyy]

+1

Как постоянный юзер такого рода
программ считаю рисовалку марвина
наиболее продвинутой. У них есть меж
прочим еще и база называется instant JChem -- 
процентов на 70 могет заменить ISIS Base. Есть
е нее определенные глюки при
структурном запросе, а так вещь!

из смотрелок могу порекомендовать
по химии

molekel
molden

по биологии
Chimera
Swiss PDB Viewer DeepView
yasara
vmd

если народу будет интересно дам ссылки
на толковые текстовые пргги для работы с
SDF

Дима

Michael Shigorin сообщил(а):
> 	Здравствуйте.
> Кто-то спрашивал, а тут случайно
> подвернулось:
>
> --- http://rus-linux.net/
> MarvinSketch Из пакета Marvin Beans от ChemAxon. На яве.
> Для
> скачивания требуется регистрация.
> Это, пожалуй, лучшая из бесплатных
> рисовалка химических формул
> для linux (и не только). По удобству и
> возможностям вполне
> сопоставима с ChemDraw. Особо стоит отметить
> возможность перевода
> нарисованных двумерных структур в
> трехмерные (благодаря
> встроенной молекулярной механике).
> Реализована (пока только в
> нестабильной версии) OLE-интеграция с
> OpenOffice.
> В комплект Marvin Beans также входят:
> MarvinView - вьювер двух- и трехмерных
> химических структур,
> MarvinSpace - программа для 3D-визуализации
> молекул и
> MolConverter - конвертер химических форматов,
> аналог OpenBabel.
> --- http://www.chemaxon.com/product/msketch.html
>
> --
>  ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
>   ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/
> _______________________________________________
> Community mailing list
> Community@lists.altlinux.org
> https://lists.altlinux.org/mailman/listinfo/community


-- 
PhD Dmytro Kovalskyy        dikov@imbg.org.ua
IMBG of UAS           tel:+380445265405
150, Zabolotnogo str,        fax:+380445260759
Kiev, 03143 Ukraine          mob:+380442019198

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Aleksander N. Gorohovski]

On Mon, 23 Apr 2007 22:41:25 +0300, Dmytro Kovalskyy wrote:

> +1
>
> Как постоянный юзер такого рода
> программ считаю рисовалку марвина
> наиболее продвинутой. У них есть меж
> прочим еще и база называется instant JChem --
> процентов на 70 могет заменить ISIS Base. Есть
> е нее определенные глюки при
> структурном запросе, а так вещь!
>
> из смотрелок могу порекомендовать
> по химии
>
> molekel
> molden
>
> по биологии
> Chimera
> Swiss PDB Viewer DeepView
> yasara
> vmd
>
> если народу будет интересно дам ссылки
> на толковые текстовые пргги для работы с
> SDF

Оч.интересно.
:)
Закиньте ссылки,
пожалуйста.

> Дима
>
> Michael Shigorin сообщил(а):
>> 	Здравствуйте.
>> Кто-то спрашивал, а тут случайно
>> подвернулось:
>>
>> --- http://rus-linux.net/
>> MarvinSketch Из пакета Marvin Beans от ChemAxon. На яве.
>> Для
>> скачивания требуется регистрация.
>> Это, пожалуй, лучшая из бесплатных
>> рисовалка химических формул
>> для linux (и не только). По удобству и
>> возможностям вполне
>> сопоставима с ChemDraw. Особо стоит отметить
>> возможность перевода
>> нарисованных двумерных структур в
>> трехмерные (благодаря
>> встроенной молекулярной механике).
>> Реализована (пока только в
>> нестабильной версии) OLE-интеграция с
>> OpenOffice.
>> В комплект Marvin Beans также входят:
>> MarvinView - вьювер двух- и трехмерных
>> химических структур,
>> MarvinSpace - программа для 3D-визуализации
>> молекул и
>> MolConverter - конвертер химических форматов,
>> аналог OpenBabel.
>> --- http://www.chemaxon.com/product/msketch.html

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Michael Shigorin]

On Mon, Apr 23, 2007 at 10:41:25PM +0300, Dmytro Kovalskyy wrote:
> если народу будет интересно дам ссылки на толковые текстовые
> пргги для работы с SDF

А не хочешь страничку на freesource.info оформить?
(я уж не говорю -- пособирать, чего мы там с тобой недособирали
тогда?)

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Denis G. Samsonenko]

День добрый!

22.04.07, Michael Shigorin написал(а):
> Кто-то спрашивал, а тут случайно подвернулось:
> --- http://rus-linux.net/
> MarvinSketch Из пакета Marvin Beans от ChemAxon. На яве. Для
> скачивания требуется регистрация.
> Это, пожалуй, лучшая из бесплатных рисовалка химических формул
> для linux (и не только). По удобству и возможностям вполне
...
> --- http://www.chemaxon.com/product/msketch.html

Рисовалок структурных формул полно, вот только если бы результаты этих
рисований можно было бы вставить в тот же ОО и сохранить формате,
понимаемом микросовтовским офисом. А то с постскриптом далеко не
уедешь.

Ну да это бог с ним, формулу в крайнем случае и вручную в любом
векторном редакторе нарисовать можно если прижмёт, в том же OODraw.

А вот полноценного и удобного визуализатора кристаллических структур я
так и не нашёл, сколько не искал. Хоть самому садись и пиши. Максимум
что могут большинство найденных -- это нарисовать как-то независимую
часть или ячейку. Но этого очень мало.

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Aleksander N.Gorohovski]

On Wed, 25 Apr 2007 19:39:44 +0400, Denis G. Samsonenko wrote:

> День добрый!
>
> 22.04.07, Michael Shigorin написал(а):
>> Кто-то спрашивал, а тут случайно подвернулось:
>> --- http://rus-linux.net/
>> MarvinSketch Из пакета Marvin Beans от ChemAxon. На яве. Для
>> скачивания требуется регистрация.
>> Это, пожалуй, лучшая из бесплатных рисовалка химических формул
>> для linux (и не только). По удобству и возможностям вполне
> ...
>> --- http://www.chemaxon.com/product/msketch.html
>
> Рисовалок структурных формул полно, вот только если бы результаты этих
> рисований можно было бы вставить в тот же ОО и сохранить формате,
> понимаемом микросовтовским офисом. А то с постскриптом далеко не
> уедешь.

А если сделать ps -> jpeg
?

> Ну да это бог с ним, формулу в крайнем случае и вручную в любом
> векторном редакторе нарисовать можно если прижмёт, в том же OODraw.

Не всякую формулу можно быстро и "красиво" нарисовать
:)

> А вот полноценного и удобного визуализатора кристаллических структур я

В ChemAxon есть визуализация 3D
(правда это не совсем кристаллическая структура)

> так и не нашёл, сколько не искал. Хоть самому садись и пиши. Максимум
> что могут большинство найденных -- это нарисовать как-то независимую
> часть или ячейку. Но этого очень мало.

Если есть алгоритм, могу присоединиться к написанию.
:)

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Denis G. Samsonenko]

День добрый!

> > Рисовалок структурных формул полно, вот только если бы результаты этих
> > рисований можно было бы вставить в тот же ОО и сохранить формате,
> > понимаемом микросовтовским офисом. А то с постскриптом далеко не
> > уедешь.
>
> А если сделать ps -> jpeg
> ?

Структурную формулу растром? И что потом будет при масштабировании?
Проблема в том, что нет единого варианта векторного формата,
понимаемого как по виндой, так и под линухом. ОО понимает wmf/emf, но
кривовато, да и ни одна прога под линух его не может генерить. А
микросовтовский офис не понимает eps и прочее подобное.

> Не всякую формулу можно быстро и "красиво" нарисовать
> :)

Не всякую, но мне редко приходится подобные формулы рисовать, я неорнаник.

> > А вот полноценного и удобного визуализатора кристаллических структур я
> В ChemAxon есть визуализация 3D
> (правда это не совсем кристаллическая структура)

Дело не только нарисовать картинку. Чтобы её нарисовать нормально,
надо, чтобы рисовалка понимала стандартные входные форматы файла,
такие как cif, понимала симметрию и кристаллографичесикую систему
координат (не всегда ортогональна), позволяла манипулировать
структурой, как то: добавлять и убирать атомы, достраивать фрагмент до
молекулы, поворачивать и увеличивать/уменьшать, менять параметры
связности. При этом ещё надо, чтобы можно было вычислять расстояния и
углы, и не только валентные.

Вот только что попробовал ещё одну рисовалку:
http://www.lwfinger.net/drawxtl. Зашибенно тормозная и конкретно
неудобная. Надо потратить уйму времени, чтобы хоть что-то нарисовать,
когда это должно делаться парой кликов.

Вот хотя бы аналог вот такой виндовой проги был бы:
http://www.toycrate.org/bs/index.html, хотя мне и она кажется не очень
удобной.

Но качественная рисовалка -- это не всё, что нужно. Данное рисование
делается уже после того, как структура полностью определена. А мне
нужен удобный инструмент во время этого процесса, когда не все атомы
найдены, но есть пики найденные из фурье-интеза. Программа которая
считает у меня есть, и она работает как под виндой, так и под линухом
(ею считают наверно 90% всех структурщиков). А вот простого и
функционального визуализатора нет. Под винду наиболее удобна XP из
пакета SHELXTL (т.к. она специально для этого создана в пару к проге,
что считает), но она только под винду и только платно.

> > так и не нашёл, сколько не искал. Хоть самому садись и пиши. Максимум
> > что могут большинство найденных -- это нарисовать как-то независимую
> > часть или ячейку. Но этого очень мало.
>
> Если есть алгоритм, могу присоединиться к написанию.
> :)

Это скорее возглас отчаяния. Я не программер и не матиматик. Я просто
не осилю скорее всего написание серьёзной проги. И если что-то и буду
делать в этом направлении, то только на паскале, т.к. только его
синтаксис мне хоть как-то понятен.

А основная трудность на мой взгляд -- это построение координационного
окружения конкретного атома, а также построение молекулы (или части её
в случае полимера). Трудность в том, что на входе у нас есть позиции
атомов независимой части и симметрия. недостающие атомы получаются из
независимых путём применения операторов симметрии. И заранее не
известно, какой оператор надо применить и к какому атому. При этом
симметрия пространственная, а не точечная, т.е. присутствуют не только
отражения, вращения, инверсия, но и трансляции.

А в остальном всё вроде довольно просто. Только придётся гонять
туда-сюда из кристаллографической в ортогональную систему координат. В
ортогональная для отрисовки и манипуляции со всей структурой в целом,
а в кристаллографическую для применения симметрии и вычисления
координат, плоскостей, длин связей, углов и т.п.

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Aleksander N.Gorohovski]

On Thu, 26 Apr 2007 06:26:09 +0400, Denis G. Samsonenko wrote:

> День добрый!
>
>> > Рисовалок структурных формул полно, вот только если бы результаты этих
>> > рисований можно было бы вставить в тот же ОО и сохранить формате,
>> > понимаемом микросовтовским офисом. А то с постскриптом далеко не
>> > уедешь.
>>
>> А если сделать ps -> jpeg
>> ?
>
> Структурную формулу растром? И что потом будет при масштабировании?

А разве jpeg (или png) это растр?

> Проблема в том, что нет единого варианта векторного формата,
> понимаемого как по виндой, так и под линухом. ОО понимает wmf/emf, но
> кривовато, да и ни одна прога под линух его не может генерить. А
> микросовтовский офис не понимает eps и прочее подобное.
>
>> Не всякую формулу можно быстро и "красиво" нарисовать
>> :)
>
> Не всякую, но мне редко приходится подобные формулы рисовать, я  
> неорнаник.

Приятно удивлен, но и я тоже.
:)

>> > А вот полноценного и удобного визуализатора кристаллических структур я
>> В ChemAxon есть визуализация 3D
>> (правда это не совсем кристаллическая структура)
>
> Дело не только нарисовать картинку. Чтобы её нарисовать нормально,
> надо, чтобы рисовалка понимала стандартные входные форматы файла,
> такие как cif, понимала симметрию и кристаллографичесикую систему
> координат (не всегда ортогональна), позволяла манипулировать
> структурой, как то: добавлять и убирать атомы, достраивать фрагмент до
> молекулы, поворачивать и увеличивать/уменьшать, менять параметры
> связности. При этом ещё надо, чтобы можно было вычислять расстояния и
> углы, и не только валентные.
>
> Вот только что попробовал ещё одну рисовалку:
> http://www.lwfinger.net/drawxtl. Зашибенно тормозная и конкретно
> неудобная. Надо потратить уйму времени, чтобы хоть что-то нарисовать,
> когда это должно делаться парой кликов.
>
> Вот хотя бы аналог вот такой виндовой проги был бы:
> http://www.toycrate.org/bs/index.html, хотя мне и она кажется не очень
> удобной.

Хорошо, я так понимаю Вы -- структурщик?
Тогда, может -- HyperChem?

> Но качественная рисовалка -- это не всё, что нужно. Данное рисование
> делается уже после того, как структура полностью определена. А мне
> нужен удобный инструмент во время этого процесса, когда не все атомы
> найдены, но есть пики найденные из фурье-интеза. Программа которая
> считает у меня есть, и она работает как под виндой, так и под линухом
> (ею считают наверно 90% всех структурщиков). А вот простого и

Если не секрет, а что это за программа?
Больно уж интересно попробовать,
ну хотя бы можно построить решетки оксидых соединений  
щелочных-щелочноземельных:
  Na2O2 .. , CaO2 ...
а лучше алюминатов, силикатов можно?

> функционального визуализатора нет. Под винду наиболее удобна XP из
> пакета SHELXTL (т.к. она специально для этого создана в пару к проге,
> что считает), но она только под винду и только платно.

А для расчёта, наверное, нужны данные дифрактограмм
(рентгенофазового-структурного анализа)?

>> > так и не нашёл, сколько не искал. Хоть самому садись и пиши. Максимум
>> > что могут большинство найденных -- это нарисовать как-то независимую
>> > часть или ячейку. Но этого очень мало.
>>
>> Если есть алгоритм, могу присоединиться к написанию.
>> :)
>
> Это скорее возглас отчаяния. Я не программер и не матиматик. Я просто
> не осилю скорее всего написание серьёзной проги. И если что-то и буду
> делать в этом направлении, то только на паскале, т.к. только его
> синтаксис мне хоть как-то понятен.

Я тоже заканчивал химфак.
Если бы хотя бы пример какой простенький (что б зацепиться) или
может подскажите доступную для восприятьия литературу,
можно попробовать (языки и математика в общем то не пугает)

> А основная трудность на мой взгляд -- это построение координационного
> окружения конкретного атома, а также построение молекулы (или части её
> в случае полимера). Трудность в том, что на входе у нас есть позиции
> атомов независимой части и симметрия. недостающие атомы получаются из
> независимых путём применения операторов симметрии. И заранее не
> известно, какой оператор надо применить и к какому атому. При этом
> симметрия пространственная, а не точечная, т.е. присутствуют не только
> отражения, вращения, инверсия, но и трансляции.

Не могли бы бросить примерчик из собственной жизни
:)

> А в остальном всё вроде довольно просто. Только придётся гонять
> туда-сюда из кристаллографической в ортогональную систему координат. В
> ортогональная для отрисовки и манипуляции со всей структурой в целом,
> а в кристаллографическую для применения симметрии и вычисления
> координат, плоскостей, длин связей, углов и т.п.

Спасибо.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Denis G. Samsonenko]

Вечер добрый!

27.04.07, Aleksander N.Gorohovski написал:
> >> А если сделать ps -> jpeg
> >> ?
> > Структурную формулу растром? И что потом будет при масштабировании?
>
> А разве jpeg (или png) это растр?

А что же это? Уж во всяком случае не вектор.

> > Вот хотя бы аналог вот такой виндовой проги был бы:
> > http://www.toycrate.org/bs/index.html, хотя мне и она кажется не очень
> > удобной.
>
> Хорошо, я так понимаю Вы -- структурщик?

Скажем так: я химик, который в состоянии самостоятельно проводить
рентгеноструктурный анализ, начиная от установки кристалла на
дифрактометр и заканчивая решеием и уточнением собственно
кристаллической структуры.

> Тогда, может -- HyperChem?

"HyperChem - комплексный программный продукт, предназначенный для
задач молекулярного моделирования. Он включает в себя программы,
реализующие методы молекулярной механики, квантовой химии и
молекулярной динамики."

Это несколько не то. Это для моделирования, а я занимаюсь определением
структуры по дифракционным данным.

> > ... Программа которая
> > считает у меня есть, и она работает как под виндой, так и под линухом
> > (ею считают наверно 90% всех структурщиков). А вот простого и
>
> Если не секрет, а что это за программа?

Та, что считает -- пакет SHELX-97. http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX/

> Больно уж интересно попробовать,
> ну хотя бы можно построить решетки оксидых соединений
> щелочных-щелочноземельных:
>   Na2O2 .. , CaO2 ...
> а лучше алюминатов, силикатов можно?

Не совсем понял. Надо нарисовать структуры соединений с известной
структурой, или что? Берётся соответствующий cif-файл из банка
структурных данных (или ещё откуда) и рисуется в соответствующей
программе. Комерческих визуализаторов полно. Нет хорошего свободного
аналога.

Из бесплатно доступных (с ограниченной функциональностью) могу
порекомендовать Mercury:
http://www.ccdc.cam.ac.uk/free_services/mercury/.

> > функционального визуализатора нет. Под винду наиболее удобна XP из
> > пакета SHELXTL (т.к. она специально для этого создана в пару к проге,
> > что считает), но она только под винду и только платно.
>
> А для расчёта, наверное, нужны данные дифрактограмм
> (рентгенофазового-структурного анализа)?

Конечно. Данные с дифрактометра.

> Я тоже заканчивал химфак.
> Если бы хотя бы пример какой простенький (что б зацепиться) или
> может подскажите доступную для восприятьия литературу,
> можно попробовать (языки и математика в общем то не пугает)

Пример чего надобен?

> > А основная трудность на мой взгляд -- это построение координационного
> > окружения конкретного атома, а также построение молекулы (или части её
> > в случае полимера). Трудность в том, что на входе у нас есть позиции
> > атомов независимой части и симметрия. недостающие атомы получаются из
> > независимых путём применения операторов симметрии. И заранее не
> > известно, какой оператор надо применить и к какому атому. При этом
> > симметрия пространственная, а не точечная, т.е. присутствуют не только
> > отражения, вращения, инверсия, но и трансляции.
>
> Не могли бы бросить примерчик из собственной жизни
> :)

Опять же пример чего?

По поводу литературы. Вот тут есть кое что в электронном виде:

http://www.iucr.org/iucr-top/comm/cteach/pamphlets.html

А так, возьмите любую книгу по кристаллографии. На русском языке новых
книг нет, только 60-х -- 70-х годов. На английском есть неплохие
книжки от международного союза кристаллографов (www.iucr.ogr), я тут
купил себе парочку.

Чувствую, что пора перебираться с этим обсуждением из этого списка
рассылки куда-нибудь, а то это всё оффтопик конкретный.

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Aleksander N.Gorohovski]

Sorry,
заканчиваю (если можно в "личку")

On Thu, 26 Apr 2007 21:39:37 +0400, Denis G. Samsonenko wrote:

> Вечер добрый!
>
> 27.04.07, Aleksander N.Gorohovski написал:
>> >> А если сделать ps -> jpeg
>> >> ?
>> > Структурную формулу растром? И что потом будет при масштабировании?
>>
>> А разве jpeg (или png) это растр?
>
> А что же это? Уж во всяком случае не вектор.
>
>> > Вот хотя бы аналог вот такой виндовой проги был бы:
>> > http://www.toycrate.org/bs/index.html, хотя мне и она кажется не очень
>> > удобной.
>>
>> Хорошо, я так понимаю Вы -- структурщик?
>
> Скажем так: я химик, который в состоянии самостоятельно проводить
> рентгеноструктурный анализ, начиная от установки кристалла на
> дифрактометр и заканчивая решеием и уточнением собственно
> кристаллической структуры.

Мне, тоже по мере надобности приходится снимать дифрактограммы (ДРОН УМ1),
но пока лишь для фазового анализа
(написал программу расшифровки и собрал ручками БД на основе ASTM, около  
6500 фаз).

>> Тогда, может -- HyperChem?
>
> "HyperChem - комплексный программный продукт, предназначенный для
> задач молекулярного моделирования. Он включает в себя программы,
> реализующие методы молекулярной механики, квантовой химии и
> молекулярной динамики."
>
> Это несколько не то. Это для моделирования, а я занимаюсь определением
> структуры по дифракционным данным.
>
>> > ... Программа которая
>> > считает у меня есть, и она работает как под виндой, так и под линухом
>> > (ею считают наверно 90% всех структурщиков). А вот простого и
>>
>> Если не секрет, а что это за программа?
>
> Та, что считает -- пакет SHELX-97. http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX/

А под ALT Linux у Вас получилось её собрать?
Насколько я знаю в основном её пользуют под DOS (возможно я ошибаюсь)
к моему большому сожалению не нашлось рядом добрых людей показать как
с ней работают.

>> Больно уж интересно попробовать,
>> ну хотя бы можно построить решетки оксидых соединений
>> щелочных-щелочноземельных:
>>   Na2O2 .. , CaO2 ...
>> а лучше алюминатов, силикатов можно?
>
> Не совсем понял. Надо нарисовать структуры соединений с известной
> структурой, или что? Берётся соответствующий cif-файл из банка
ну, хотя бы так.

> структурных данных (или ещё откуда) и рисуется в соответствующей

банк данных? Не подскажите где его обычно можно найти

> программе. Комерческих визуализаторов полно. Нет хорошего свободного
> аналога.
>
> Из бесплатно доступных (с ограниченной функциональностью) могу
> порекомендовать Mercury:
> http://www.ccdc.cam.ac.uk/free_services/mercury/.

А в ней есть этот самый банк данных cif-файлов

>> > функционального визуализатора нет. Под винду наиболее удобна XP из
>> > пакета SHELXTL (т.к. она специально для этого создана в пару к проге,
>> > что считает), но она только под винду и только платно.
>>
>> А для расчёта, наверное, нужны данные дифрактограмм
>> (рентгенофазового-структурного анализа)?
>
> Конечно. Данные с дифрактометра.
>
>> Я тоже заканчивал химфак.
>> Если бы хотя бы пример какой простенький (что б зацепиться) или
>> может подскажите доступную для восприятьия литературу,
>> можно попробовать (языки и математика в общем то не пугает)
>
> Пример чего надобен?
Наверное я неправильно сформулировал мысль из-за того, что не приходилось
работать с той же SHELX-97 и плохо представил, что и в каком виде обычно  
задают
для расчёта структур. Рефлексы? Элементный состав кристалла?


>> > А основная трудность на мой взгляд -- это построение координационного
>> > окружения конкретного атома, а также построение молекулы (или части её
>> > в случае полимера). Трудность в том, что на входе у нас есть позиции
>> > атомов независимой части и симметрия. недостающие атомы получаются из
>> > независимых путём применения операторов симметрии. И заранее не
>> > известно, какой оператор надо применить и к какому атому. При этом
>> > симметрия пространственная, а не точечная, т.е. присутствуют не только
>> > отражения, вращения, инверсия, но и трансляции.
>>
>> Не могли бы бросить примерчик из собственной жизни
>> :)
>
> Опять же пример чего?
>
> По поводу литературы. Вот тут есть кое что в электронном виде:
>
> http://www.iucr.org/iucr-top/comm/cteach/pamphlets.html

> А так, возьмите любую книгу по кристаллографии. На русском языке новых
> книг нет, только 60-х -- 70-х годов. На английском есть неплохие
Удивительно, что никто даже не перевёл. Мне кажется это очень интересно.

> книжки от международного союза кристаллографов (www.iucr.ogr), я тут
> купил себе парочку.

Через интернет?

> Чувствую, что пора перебираться с этим обсуждением из этого списка
> рассылки куда-нибудь, а то это всё оффтопик конкретный.
Да, согласен.

Премного благодарен,
Извините, что утомил Вас и остальных (кто не спит) наивными вопросами.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Faizov Alisher]

> Премного благодарен,
> Извините, что утомил Вас и остальных (кто не спит) наивными вопросами.

Того и гляди химию выучу:) 

[Comm] касательно обсуждений научного софта

[Michael Shigorin]

On Fri, Apr 27, 2007 at 02:39:37AM +0900, Denis G. Samsonenko wrote:
> Чувствую, что пора перебираться с этим обсуждением из этого
> списка рассылки куда-нибудь, а то это всё оффтопик конкретный.

Ну почему конкретный.  А перебраться заспокойно можно
в smoke-room@ или если есть ещё желающих обсудить, например,
использование ворда математиками после нонешних вузов -- 
никаких проблем поднять ещё одну рассылку (или
@lists.altlinux.org, или @lists.osdn.org.ua).

Был бы толк.

-- 
http://web.archive.org/web/20031120194159/http://www.sal.kachinatech.com/

Re: [Comm] касательно обсуждений научного софта

[Andrii Dobrovol`s`kii]

[-- Attachment #1: Type: text/plain, Size: 1067 bytes --]

Michael Shigorin пишет:
> On Fri, Apr 27, 2007 at 02:39:37AM +0900, Denis G. Samsonenko wrote:
>> Чувствую, что пора перебираться с этим обсуждением из этого
>> списка рассылки куда-нибудь, а то это всё оффтопик конкретный.
> 
> Ну почему конкретный.  А перебраться заспокойно можно
> в smoke-room@ или если есть ещё желающих обсудить, например,
> использование ворда математиками после нонешних вузов -- 
> никаких проблем поднять ещё одну рассылку (или
> @lists.altlinux.org, или @lists.osdn.org.ua).
> 
> Был бы толк.
> 
Миш, у тебя прям неодолимая тяга к поднятию новых рассылок... :)
Есть же уже edu@. ИМХО, самое то место. И студенты будут заранее
знать, что "не Вордом единым..."
-- 
Rgrds,
Andriy
*********************************************************************
email: dobr at iop dot kiev dot ua            Kyiv, Ukraine
Phone: (380-44)   525-7824            Department of Gas Electronics
Fax:   (380-44)   525-2329             Institute of Physics of NASU
*********************dobrATjabber.iop.kiev.ua************************


[-- Attachment #2: OpenPGP digital signature --]
[-- Type: application/pgp-signature, Size: 189 bytes --]

Re: [Comm] касательно обсуждений научного софта

[Michael Shigorin]

On Fri, Apr 27, 2007 at 12:15:47PM +0300, Andrii Dobrovol`s`kii wrote:
> >> Чувствую, что пора перебираться с этим обсуждением из этого
> >> списка рассылки куда-нибудь, а то это всё оффтопик конкретный.
> > Ну почему конкретный.  А перебраться заспокойно можно
> > в smoke-room@ или если есть ещё желающих обсудить, например,
> > использование ворда математиками после нонешних вузов -- 
> > никаких проблем поднять ещё одну рассылку (или
> > @lists.altlinux.org, или @lists.osdn.org.ua).
> > Был бы толк.
> Миш, у тебя прям неодолимая тяга к поднятию новых рассылок... :)

Отнюдь, просто плохо, когда люди уходят в приватные обсуждения
с вообще-то более общеполезными темами.

> Есть же уже edu@. ИМХО, самое то место. И студенты будут
> заранее знать, что "не Вордом единым..."

Эээ... ну кстати, тоже вариант.

http://lists.osdn.org.ua/wws/info/edu

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Michael Shigorin]

On Thu, Apr 26, 2007 at 07:53:19PM +0400, Aleksander N.Gorohovski wrote:
> >> > Рисовалок структурных формул полно, вот только если бы
> >> > результаты этих рисований можно было бы вставить в тот же
> >> > ОО и сохранить формате, понимаемом микросовтовским офисом.
> >> > А то с постскриптом далеко не уедешь.
> >> А если сделать ps -> jpeg ?
> > Структурную формулу растром? И что потом будет при масштабировании?

Плохо будет.

> А разве jpeg (или png) это растр?

Исключительно.

> > Это скорее возглас отчаяния. Я не программер и не матиматик.
> Я тоже заканчивал химфак.

Аналогично.


> > Я просто не осилю скорее всего написание серьёзной проги. И
> > если что-то и буду делать в этом направлении, то только на
> > паскале, т.к. только его синтаксис мне хоть как-то понятен.

Тут проще плясать не от того, чему учили-учили и так и не научили
(потому, что и сами не знали), а от того, что уже есть.

По крайней мере с фрисофтом, где получается участвовать
в разработке или пользоваться готовыми библиотеками.

> Если бы хотя бы пример какой простенький (что б зацепиться) или
> может подскажите доступную для восприятьия литературу, можно
> попробовать (языки и математика в общем то не пугает)

Можно попробовать познакомить с народом в univ.kiev.ua, 
вдруг чего толкового получится.

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Aleksander N.Gorohovski]

On Thu, 26 Apr 2007 23:59:06 +0400, Michael Shigorin wrote:

> On Thu, Apr 26, 2007 at 07:53:19PM +0400, Aleksander N.Gorohovski wrote:
>> >> > Рисовалок структурных формул полно, вот только если бы
>> >> > результаты этих рисований можно было бы вставить в тот же
>> >> > ОО и сохранить формате, понимаемом микросовтовским офисом.
>> >> > А то с постскриптом далеко не уедешь.
>> >> А если сделать ps -> jpeg ?
>> > Структурную формулу растром? И что потом будет при масштабировании?
>
> Плохо будет.
>
>> А разве jpeg (или png) это растр?
>
> Исключительно.
>
>> > Это скорее возглас отчаяния. Я не программер и не матиматик.
>> Я тоже заканчивал химфак.
>
> Аналогично.
>
>
>> > Я просто не осилю скорее всего написание серьёзной проги. И
>> > если что-то и буду делать в этом направлении, то только на
>> > паскале, т.к. только его синтаксис мне хоть как-то понятен.
>
> Тут проще плясать не от того, чему учили-учили и так и не научили
> (потому, что и сами не знали), а от того, что уже есть.
>
> По крайней мере с фрисофтом, где получается участвовать
> в разработке или пользоваться готовыми библиотеками.
>
>> Если бы хотя бы пример какой простенький (что б зацепиться) или
>> может подскажите доступную для восприятьия литературу, можно
>> попробовать (языки и математика в общем то не пугает)
>
> Можно попробовать познакомить с народом в univ.kiev.ua,
> вдруг чего толкового получится.

Может и так.
Миша, может Вы с кем сведёте?
Вы как будто из тех краёв.
:)

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Denis G. Samsonenko]

Утро доброе!

27.04.07, Michael Shigorin написал:
> Тут проще плясать не от того, чему учили-учили и так и не научили
> (потому, что и сами не знали), а от того, что уже есть.
>
> По крайней мере с фрисофтом, где получается участвовать
> в разработке или пользоваться готовыми библиотеками.

Готовые библиотеки есть. Есть старые на фортране, есть новые на C++.
Найти можно тут: http://cctbx.sourceforge.net/. Там же есть и биндинги
к питону. Но тогда этим точно не я заниматься буду. C++ я вообще никак
не понимаю, да и вообще ООП.

Есть несколько попыток написать свободую рисовалку структур. Вот
например: http://gdis.sourceforge.net/. На скриншотах выглядит
неплохо, но когда я её пробовал, меня это не удовлетворило. Надо будет
ещё раз попробовать, может чего уже к лучшему поменялось.

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Andrii Dobrovol`s`kii]

[-- Attachment #1: Type: text/plain, Size: 881 bytes --]

Denis G. Samsonenko пишет:
> Утро доброе!
-порезано-
> Есть несколько попыток написать свободую рисовалку структур. Вот
> например: http://gdis.sourceforge.net/. На скриншотах выглядит
> неплохо, но когда я её пробовал, меня это не удовлетворило. Надо будет
> ещё раз попробовать, может чего уже к лучшему поменялось.
> 
Так Вы не просто пробуйте! Вы с авторами связывайтесь и пишите им,
что Вас не устраивает и _почему_. Они или реализуют или объяснят как
добиться желаемого с тем, что уже реализовано...
-- 
Rgrds,
Andriy
*********************************************************************
email: dobr at iop dot kiev dot ua            Kyiv, Ukraine
Phone: (380-44)   525-7824            Department of Gas Electronics
Fax:   (380-44)   525-2329             Institute of Physics of NASU
*********************dobrATjabber.iop.kiev.ua************************


[-- Attachment #2: OpenPGP digital signature --]
[-- Type: application/pgp-signature, Size: 189 bytes --]

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Denis G. Samsonenko]

Привет!

27.04.07, Andrii Dobrovol`s`kii написал:
> > Есть несколько попыток написать свободую рисовалку структур. Вот
> > например: http://gdis.sourceforge.net/. На скриншотах выглядит
> > неплохо, но когда я её пробовал, меня это не удовлетворило. Надо будет
> > ещё раз попробовать, может чего уже к лучшему поменялось.
> >
> Так Вы не просто пробуйте! Вы с авторами связывайтесь и пишите им,
> что Вас не устраивает и _почему_. Они или реализуют или объяснят как
> добиться желаемого с тем, что уже реализовано...

Уже собрал и опробовал. В общем всё как всегда: рисует ячейку и на
этом успокаивается. Добиться чего-то большего не удалось. Хотя зачатки
у этой проги хорошие, вот бы только недостающую базовую
функциональность реализовали бы.

Накатал письмо аврору с предложением чего в первую очередь реализовать
надобно. Отправлю как только жена мой английский проверит. :)

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Andrii Dobrovol`s`kii]

[-- Attachment #1: Type: text/plain, Size: 1465 bytes --]

Denis G. Samsonenko пишет:
> Привет!
> 
> 27.04.07, Andrii Dobrovol`s`kii написал:
>>> Есть несколько попыток написать свободую рисовалку структур. Вот
>>> например: http://gdis.sourceforge.net/. На скриншотах выглядит
>>> неплохо, но когда я её пробовал, меня это не удовлетворило. Надо будет
>>> ещё раз попробовать, может чего уже к лучшему поменялось.
>>>
>> Так Вы не просто пробуйте! Вы с авторами связывайтесь и пишите им,
>> что Вас не устраивает и _почему_. Они или реализуют или объяснят как
>> добиться желаемого с тем, что уже реализовано...
> 
> Уже собрал и опробовал. В общем всё как всегда: рисует ячейку и на
> этом успокаивается. Добиться чего-то большего не удалось. Хотя зачатки
> у этой проги хорошие, вот бы только недостающую базовую
> функциональность реализовали бы.
> 
> Накатал письмо аврору с предложением чего в первую очередь реализовать
> надобно. Отправлю как только жена мой английский проверит. :)
> 
Главное, не останавливайтесь на одном письме. Все мы люди занятые и
авторы программ тоже. Хотя, конечно, не все авторы достаточно
вменяемы...
-- 
Rgrds,
Andriy
*********************************************************************
email: dobr at iop dot kiev dot ua            Kyiv, Ukraine
Phone: (380-44)   525-7824            Department of Gas Electronics
Fax:   (380-44)   525-2329             Institute of Physics of NASU
*********************dobrATjabber.iop.kiev.ua************************


[-- Attachment #2: OpenPGP digital signature --]
[-- Type: application/pgp-signature, Size: 189 bytes --]

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Yury Aliaev]

Denis G. Samsonenko scripsit:
> 
> Рисовалок структурных формул полно, вот только если бы результаты этих
> рисований можно было бы вставить в тот же ОО и сохранить формате,
> понимаемом микросовтовским офисом. А то с постскриптом далеко не
> уедешь.
> 

Ну, не всё так глухо, как год назад :-) (когда меня прижала аналогичная 
ситуация). Во-первых, связку постскрипт + TeX никто не отменял :-) Кроме 
того, есть замечательная программа pstoedit, которая умеет прилично 
конвертировать постскрипт много во что, кажется даже, научилась 
создавать рисунки ООо, и точно умеет (сам пользовался) в svg. А нынешний 
инкскейп умеет этот самый svg сохранять в т.ч. и в рисунки ООо :-)

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Denis G. Samsonenko]

Привет!

27.04.07, Yury Aliaev написал:
> > Рисовалок структурных формул полно, вот только если бы результаты этих
> > рисований можно было бы вставить в тот же ОО и сохранить формате,
> > понимаемом микросовтовским офисом. А то с постскриптом далеко не
> > уедешь.
>
> Ну, не всё так глухо, как год назад :-) (когда меня прижала аналогичная
> ситуация). Во-первых, связку постскрипт + TeX никто не отменял :-) Кроме

Да я бы и рад использовать LaTeX, но все вокруг используют MSWord, и в
журналах тоже принимают рукописи в вордовском формате. А даже если и
принимают tex-файлы, то потом всё равно конвертят в rtf. Так что
TeX/LaTeX остаётся только для личного пользования, когда не надо
отправлять куда-нибудь наружу.

> того, есть замечательная программа pstoedit, которая умеет прилично
> конвертировать постскрипт много во что, кажется даже, научилась
> создавать рисунки ООо, и точно умеет (сам пользовался) в svg. А нынешний
> инкскейп умеет этот самый svg сохранять в т.ч. и в рисунки ООо :-)

Угу, через 10 стадий. Вот только что произойдёт с кириллическими
надписями при таких пертурбациях из одного формата в другой?

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Yury Aliaev]

Привет, Denis!
> 
>>>Рисовалок структурных формул полно, вот только если бы результаты этих
>>>рисований можно было бы вставить в тот же ОО и сохранить формате,
>>>понимаемом микросовтовским офисом. А то с постскриптом далеко не
>>>уедешь.
>>
>>Ну, не всё так глухо, как год назад :-) (когда меня прижала аналогичная
>>ситуация). Во-первых, связку постскрипт + TeX никто не отменял :-) Кроме
> 
> 
> Да я бы и рад использовать LaTeX, но все вокруг используют MSWord, и в
> журналах тоже принимают рукописи в вордовском формате. А даже если и

Значит, это неправильные журналы ;-) Правильные даже если и принимают в 
Ворде (в дополнение к ТеХу), то рисунки просят присылать отдельными 
файлами, желательно постскриптовыми.

> принимают tex-файлы, то потом всё равно конвертят в rtf. Так что
> TeX/LaTeX остаётся только для личного пользования, когда не надо
> отправлять куда-нибудь наружу.
> 
> 
>>того, есть замечательная программа pstoedit, которая умеет прилично
>>конвертировать постскрипт много во что, кажется даже, научилась
>>создавать рисунки ООо, и точно умеет (сам пользовался) в svg. А нынешний
>>инкскейп умеет этот самый svg сохранять в т.ч. и в рисунки ООо :-)
> 
> Угу, через 10 стадий. Вот только что произойдёт с кириллическими
> надписями при таких пертурбациях из одного формата в другой?
> 

Ну не 10, а 2 :-) Если при экспорте в ps преобразовывать шрифты в 
кривые, то без разницы, кириллица там или китаица...

[Comm] [JT] Re: химическую рисовалку кто спрашивал?

[Michael Shigorin]

On Fri, Apr 27, 2007 at 05:05:35PM +0400, Yury Aliaev wrote:
> > Да я бы и рад использовать LaTeX, но все вокруг используют
> > MSWord, и в журналах тоже принимают рукописи в вордовском
> > формате. А даже если и
> Значит, это неправильные журналы ;-) Правильные даже если и
> принимают в Ворде (в дополнение к ТеХу), то рисунки просят
> присылать отдельными файлами, желательно постскриптовыми.

Химические... с химтехами как-то никто не успел плотно
подружиться навсегда. :-(

Плавали, знаем.  Хотя две дипломные на потоке были прочитаны
с замечанием "ух ты, как настоящие статьи выглядят". ;-)

-- 
 ---- WBR, Michael Shigorin <mike@altlinux.ru>
  ------ Linux.Kiev http://www.linux.kiev.ua/

Re: [Comm] [JT] Re: химическую рисовалку кто спрашивал?

[Aleksander N.Gorohovski]

On Fri, 27 Apr 2007 18:13:58 +0400, Michael Shigorin wrote:

> On Fri, Apr 27, 2007 at 05:05:35PM +0400, Yury Aliaev wrote:
>> > Да я бы и рад использовать LaTeX, но все вокруг используют
>> > MSWord, и в журналах тоже принимают рукописи в вордовском
>> > формате. А даже если и
>> Значит, это неправильные журналы ;-) Правильные даже если и
>> принимают в Ворде (в дополнение к ТеХу), то рисунки просят
>> присылать отдельными файлами, желательно постскриптовыми.
>
> Химические... с химтехами как-то никто не успел плотно
> подружиться навсегда. :-(
>
> Плавали, знаем.  Хотя две дипломные на потоке были прочитаны
> с замечанием "ух ты, как настоящие статьи выглядят". ;-)

По поводу дипломных, курсовых -- у нас студенты работы верстают
в LaTeX (MikTeX) как положено по ГОСТУ / ДСТУ отступами,  
названиями/подписями
таблиц/рисугков, Приложений, с рамками+штампами и без
с проверкой орфографии (русская/украинская) и прочее.
Для этого и Web-ресурс сделан (Web-морда для вёрстке на сервере)

http://peooc.donntu.edu.ua/aladin/

Вообще он открыт для свободного применения всеми.
 

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Denis G. Samsonenko]

Привет!

27.04.07, Yury Aliaev написал:
> > Да я бы и рад использовать LaTeX, но все вокруг используют MSWord, и в
> > журналах тоже принимают рукописи в вордовском формате. А даже если и
>
> Значит, это неправильные журналы ;-) Правильные даже если и принимают в
> Ворде (в дополнение к ТеХу), то рисунки просят присылать отдельными
> файлами, желательно постскриптовыми.

Ну, картинки то конечно отдельными файлами запрашивают, куда без
этого. Но рукопись то всё равно в ворде приходится делать, и рисунки
туда вставлять тоже приходится. Мало того, сейчас вообще принято брать
с сайта журнала темплат вордовский и прямо туда статью вписывать,
вместе с рисунками. А тут уж без понимаемых вордом рисунков никак не
обойтись, даже если их можно будет отдельно в виде eps посылать.

> > принимают tex-файлы, то потом всё равно конвертят в rtf. Так что
> > TeX/LaTeX остаётся только для личного пользования, когда не надо
> > отправлять куда-нибудь наружу.

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Yury Aliaev]

Denis G. Samsonenko scripsit:

>>>Да я бы и рад использовать LaTeX, но все вокруг используют MSWord, и в
>>>журналах тоже принимают рукописи в вордовском формате. А даже если и
>>
>>Значит, это неправильные журналы ;-) Правильные даже если и принимают в
>>Ворде (в дополнение к ТеХу), то рисунки просят присылать отдельными
>>файлами, желательно постскриптовыми.
> 
> 
> Ну, картинки то конечно отдельными файлами запрашивают, куда без
> этого. Но рукопись то всё равно в ворде приходится делать, и рисунки
> туда вставлять тоже приходится. Мало того, сейчас вообще принято брать
> с сайта журнала темплат вордовский и прямо туда статью вписывать,
> вместе с рисунками. А тут уж без понимаемых вордом рисунков никак не
> обойтись, даже если их можно будет отдельно в виде eps посылать.

Ужоззз!!! Куда мир катиццо!

P.S. Хорошо быть физиком :-)...

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Aleksander N. Gorohovski]

On Sat, 28 Apr 2007 11:00:30 +0300, Yury Aliaev wrote:

> Denis G. Samsonenko scripsit:
>
>>>> Да я бы и рад использовать LaTeX, но все вокруг используют MSWord, и в
>>>> журналах тоже принимают рукописи в вордовском формате. А даже если и
>>>
>>> Значит, это неправильные журналы ;-) Правильные даже если и принимают в
>>> Ворде (в дополнение к ТеХу), то рисунки просят присылать отдельными
>>> файлами, желательно постскриптовыми.
>>
>>
>> Ну, картинки то конечно отдельными файлами запрашивают, куда без
>> этого. Но рукопись то всё равно в ворде приходится делать, и рисунки
>> туда вставлять тоже приходится. Мало того, сейчас вообще принято брать
>> с сайта журнала темплат вордовский и прямо туда статью вписывать,
>> вместе с рисунками. А тут уж без понимаемых вордом рисунков никак не
>> обойтись, даже если их можно будет отдельно в виде eps посылать.
>
> Ужоззз!!! Куда мир катиццо!

Не переживайте, химию постепенно съедает физика.
:)

> P.S. Хорошо быть физиком :-)...

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Denis G. Samsonenko]

День добрый!

28.04.07, Aleksander N. Gorohovski написал:
> > Ужоззз!!! Куда мир катиццо!
>
> Не переживайте, химию постепенно съедает физика.
> :)

Что-то как-то не заметно. Прямо как крокодилы летают, низенько-низенько...

-- 
Всего доброго,

Денис.

Re: [Comm] [JT] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Yury Aliaev]

Denis G. Samsonenko scripsit:
> 
>>>Ужоззз!!! Куда мир катиццо!
>>
>>Не переживайте, химию постепенно съедает физика.
>>:)
> 
> 
> Что-то как-то не заметно. Прямо как крокодилы летают, низенько-низенько...
> 

Заметно-заметно, я как раз отношусь к числу таких крокодилов ;-) 
Закончил физфак по специальности "физика конденсированного состояния", 
работаю с органическими молекулами, плотно контактирую с 
химиками-синтетиками, да и сам в химии поднаторел. Кстати, знакомые 
химики часто публикуются в журнале технической физики и подобных.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Yury Aliaev]

Denis G. Samsonenko scripsit:

>>>Да я бы и рад использовать LaTeX, но все вокруг используют MSWord, и в
>>>журналах тоже принимают рукописи в вордовском формате. А даже если и
>>
>>Значит, это неправильные журналы ;-) Правильные даже если и принимают в
>>Ворде (в дополнение к ТеХу), то рисунки просят присылать отдельными
>>файлами, желательно постскриптовыми.
> 
> 
> Ну, картинки то конечно отдельными файлами запрашивают, куда без
> этого. Но рукопись то всё равно в ворде приходится делать, и рисунки
> туда вставлять тоже приходится. Мало того, сейчас вообще принято брать

Если рисунки отдельно запрашивают, то в сам текст, наверное, можно что 
угодно вставлять, хоть растр на 75 dpi.

Re: [Comm] химическую рисовалку кто спрашивал?

[Denis G. Samsonenko]

День добрый!

28.04.07, Yury Aliaev написал:
> > Ну, картинки то конечно отдельными файлами запрашивают, куда без
> > этого. Но рукопись то всё равно в ворде приходится делать, и рисунки
> > туда вставлять тоже приходится. Мало того, сейчас вообще принято брать
>
> Если рисунки отдельно запрашивают, то в сам текст, наверное, можно что
> угодно вставлять, хоть растр на 75 dpi.

Это же не наш метод. :)

А вообще, картинки отдельно запрашивают уже после того, как статья
прошла рецензирование и принята к публикации. А до этого отсылается
только рукопись, одним файлом, вместе с картинками, таблицами и прочим
стафом.

-- 
Всего доброго,

Денис.