Здравствуйте !
On Wednesday 21 September 2016 07:33:41 Алексей Варакин написал(а):

> Правда, перед запуском VirtualBox мне пришлось обновить все пакеты в
> системе и обновить само ядро, а то /sbin/vboxconfig работать не желал без
> данных обновлений.

Почему пришлось?
https://www.altlinux.org/VirtualBox

Тут так и написано:

"Для сборки модулей ядра, которые нужны для VirtualBox (или VM Ware), в 
системе должен быть установлен пакет kernel-headers-modules той же версии, 
что и используемое ядро.

Посмотрите, какая версия ядра установлена у вас в системе. Например:

 [alexei@threebears ~]$ uname -r
 2.6.27-std-ll-alt7

Как видно, в системе установлено ядро 2.6.27-std-ll-alt7. То есть, для сборки 
модулей под него нужно установить пакет kernle-headers-modules-std-ll версии 
2.6.27-alt7.

Проверить, установлен ли у вас такой пакет, можно так

 [alexei@threebears ~]$ rpm -qa | grep headers-modules
 kernel-headers-modules-std-ll-2.6.27-alt7
 kernel-headers-modules-std-def-2.6.27-alt7

Как видно, в данной системе он установлен.

Если в вашей системе этого пакета нет, установите его командой

 apt-get install kernel-headers-modules-std-ll

Примечание: Советую запретить apt-у автоматом обновлять пакеты 
kernel-headers-* ("захолдить") эти пакеты"


-- 
C уважением, Хихин Руслан.