При апдейте с предыдущей версии mrtg-2.9.25-alt1 результат работы PREIN script'а
(добавление пользователя mrtg) уничтожается POSTUN скриптом из mrtg-2.9.25-alt1

workaround:

после апдейта вручную выполнить добавление пользователя mrtg + исправление прав
на директории наследующими командами:

/usr/sbin/groupadd -r -f mrtg &> /dev/null
/usr/sbin/useradd -r -g mrtg -d /dev/null -s /dev/null -n mrtg &> /dev/null

find /etc/mrtg /var/www/html/mrtg -nouser -print0 -exec chown mrtg \{\} \;