Re: [sisyphus] binutils problem?

[Ivan Adzhubey <iadzhubey@rics.bwh.harvard.edu>]

On Tuesday 25 April 2006 00:45, Alexey Tourbin wrote:
> On Tue, Apr 25, 2006 at 12:38:47AM -0400, Ivan Adzhubey wrote:
> > Собрал, уже 2.3.0 вышел. Я его собираю с GotoBLAS, с lapack пока не
> > пробовал, хотя из GotoBLAS можно собрать и оптимизированый lapack тоже. С
> > оптимизированым BLAS ускорение векторных операций на P4 очень
> > существенное, раза в три на некоторых задачах. Пробовал также ATLAS, но
> > они сами признают, что до скоростных результатов творения Казушиге Гото
> > им далеко, а процесс автоматической оптимизации там просто ужасный, на
> > некоторых архитектурах сборка занимает двое суток. Наша наука подсела на
> > R конкретно, без него как без рук. Очень было жаль, когда из Сизифа он
> > пропал, но с другой стороны - я не представляю как с этими оптимизациями
> > можно разобраться в общем виде, а без них - тоскливо. Так что все равно
> > видимо придется собирать самому и дальше.
>
> Я рассматривал варианты LAPACK vs ATLAS и пока решил остановиться на
> LAPACK, потому что он "стандартный", а ATLAS даёт только частичную
> реализацию LAPACK'а (хотя и полный BLAS).

Мне нужен именно BLAS, а LAPACK - не очень.

> В три раза - не верю. :)

Я тоже глазам не поверил. Но я не делал формальных бенчмарков, речь идет о 
моем собственном R-коде. Вполне возможно, что он изначально был крив ;-) Если 
вы с R сталкивались, то знаете, что там нетрудно написать невероятно 
медленную программу ;-).

> Какая лицензия у GotoBLAS?  Надо за этим внимательно следить,
> а то легко подсесть на проприетарщину.

Он как раз недавно стал open source, но free только для academic use. Я честно 
говоря не разбирался в подробностях лицензии, academic - это нам подходит, а 
с ATLAS (который GPL) я ужасно намучался.

-- 
Иван