Следующие библиотеки предлагается считать "системными".

$ ./aptbox/apt-cache dump |perl_dict |awk '$1>20 && $2~/^lib..*[.]so[^(]*$/'
21      libXau.so.6
21      libgssapi_krb5.so.2
21      libcups.so.2
21      libdbus-1.so.1
21      libfltk.so.1.1
21      libORBitCosNaming.so.0
22      libpangox-1.0.so.0
23      libgmp.so.3
23      libIIOP.so.0
23      libORBitutil.so.0
23      libxml.so.1
23      libORBit.so.0
24      libusb-0.1.so.4
24      libtk8.4.so
24      libsndfile.so.1(libsndfile.so.1.0)
24      libuuid.so.1
24      libslang.so.1
25      libXcursor.so.1
25      libImlib2.so.1
25      libcap.so.1
25      libgnomeprintui-2-2.so.0
25      libFLAC.so.7
25      libpangoxft-1.0.so.0
26      libgcrypt.so.11
26      libidn.so.11
26      libgnomeprint-2-2.so.0
26      libsndfile.so.1
28      libXtst.so.6
28      libkrb5.so.3
28      libXp.so.6
28      libk5crypto.so.3
28      libartsc.so.0
29      libgpg-error.so.0
29      libsasl2.so.2
29      librsvg-2.so.2
29      liblcms.so.1
29      libstdc++.so.5
30      libvorbisenc.so.2
31      libgdbm.so.3
32      libkdegames.so.1
32      libkutils.so.1
33      libguile-ltdl.so.1
33      libpq.so.4
33      libXaw.so.8
33      libxmms.so.1
33      libXxf86dga.so.1
33      libqthreads.so.12
34      libcurl.so.3
34      libpanel-applet-2.so.0
35      libgnomesupport.so.0
35      libart_lgpl.so.2
35      libwrap.so.0
35      libgnome.so.32
35      libgnomeui.so.32
35      libSDL_image-1.2.so.0
36      libkabc.so.1
36      libpython2.4.so.1.0
36      libgdk_pixbuf.so.2
36      libguile.so.12
37      libcom_err.so.2
37      libjack.so.0
38      libXv.so.1
38      libmad.so.0
39      libXrandr.so.2
39      libkhtml.so.4
42      libgnomecanvas-2.so.0
42      libart_lgpl_2.so.2
43      libSDL_mixer-1.2.so.0
43      libgpm.so.1
43      libgthread-1.2.so.0
44      libxslt.so.1
44      libdb.so.2
44      libgdk_imlib.so.1
46      libtcl8.4.so
46      libbonobo-activation.so.4
47      libkdefx.so.4
49      libpcap.so.0.8
49      libORBit-2.so.0
49      libpcre.so.3
50      libruby.so.1.8
53      libvorbisfile.so.3
53      liblber-2.2.so.7
55      libbonoboui-2.so.0
56      libdb-4.3.so
56      libfontconfig.so.1
59      libbonobo-2.so.0
60      libmysqlclient.so.12
60      libldap-2.2.so.7
64      libXxf86vm.so.1
64      libogg.so.0
65      libbz2.so.1
66      libhistory.so.4.3
66      libexpat.so.0
70      librt.so.1
71      libvorbis.so.0
71      libXinerama.so.1
78      libXrender.so.1
79      libXft.so.2
80      libGLU.so.1
81      libkdeprint.so.4
83      libaudiofile.so.0
83      libesd.so.0
84      libpam.so.0
86      libtiff.so.4
95      libkparts.so.2
97      libgstreamer-0.8.so.1
98      libatk-1.0.so.0
101     libutil.so.1
103     libreadline.so.4.3
105     libasound.so.2
109     libgnomevfs-2.so.0
111     libXmu.so.6
115     libDCOP.so.4
117     libGL.so.1
121     libgmodule-1.2.so.0
124     libglade-2.0.so.0
128     libXi.so.6
132     libgmodule-2.0.so.0
136     libgdk-1.2.so.0
141     libgthread-2.0.so.0
142     libgconf-2.so.4
143     libSDL-1.2.so.0
154     libXpm.so.4
157     libgnome-2.so.0
158     libresolv.so.2
160     libpango-1.0.so.0
160     libXt.so.6
160     libperl.so.5.8
172     libpopt.so.0
174     libtinfo.so.5
177     libgnomeui-2.so.0
181     libfreetype.so.6
182     libglib-1.2.so.0
186     libgtk-1.2.so.0
194     libxml2.so.2
208     libncurses.so.5
211     libjpeg.so.62
230     libssl.so.4
237     libpng12.so.0
244     libgdk_pixbuf-2.0.so.0
252     libkio.so.4
253     libcrypt.so.1
268     libcrypto.so.4
280     libnsl.so.1
280     libkdecore.so.4
285     libkdeui.so.4
286     libgdk-x11-2.0.so.0
361     libqt-mt.so.3
391     libgobject-2.0.so.0
453     libgtk-x11-2.0.so.0
474     libglib-2.0.so.0
495     libSM.so.6
497     libICE.so.6
577     libXext.so.6
822     libz.so.1
866     libX11.so.6
869     libgcc_s.so.1
903     libdl.so.2
978     libstdc++.so.6
1316    libpthread.so.0
2099    libm.so.6
4373    libc.so.6
$

Цифра в левой колонке примерно соответствует количеству пакетов, которые
имеют зависимость на эту (в правой колонке) библиотеку.