Разобрался методом научного тыка.
PARAM='--quote-names --add-drop-database --add-drop-table
--compatible=mysql40 --default-character-set=koi8r "
base="elan_ext_new"
mysqldump $PARAM -B $b > $b.sql

При этом в my.cnf
default-character-set=koi8_ru

-- 
С уважением,
Дубровский Вячеслав.